进入后面的门，听见呼救声。原来Warden院长被困在中间的监控室里，此时过场女小丑放出了毒藤女和囚犯。解救院长后得到解锁器。使用方法是右键准备解锁器左键选择锁，然后先用A,D调整左旋钮到屏幕浅绿，鼠标左右键调整右旋钮，屏幕深绿时就可解锁。
打开电子门出去后发现原来楼下关着的警卫变成了Warden和Gordon，难道这又是幻觉？原路返回,在Main Cell Block遇见女小丑，此时地板被通电，迅速飞到二楼平台，解决掉一群喽啰后女小丑逃走。将2楼房间内的控制器干掉，使一楼地板断电。
来到Guard Room,见到女小丑将两个警卫吊起来。先将下图中左右两个控制器依次干掉，让人质下面的水断电。
有2分钟时间限制，速度要快。飞镖救两人下来，这时候箱子变成定时炸弹，时间倒计时30秒，速度把电门解锁逃生。出来后直走，来到Controlles Access,从这里上去。
破坏电门后下到一楼，来到Extreme Incarceration,在这里迎接3波小兵的挑战，这里有三个平台，会按照中-右-左的顺序循环放电，注意躲避。过场中女小丑亲自下来挑战蝙蝠侠...被秒掉，光荣回到铁窗生活。取得女小丑指纹，原路返回离开Penitentiary。
地点：Botanical Garden
一路消灭小兵，顺着地图指示来到植物园53。
消灭守门的两个持枪歹徒，破掉电子门。如图，大厅里戒备森严，共有6个枪兵。