据有关资料记载，早在民国38年(1949年)6月初， 国民党 福州绥靖公署就派军统王调勋到闽江口川石岛，以原军统闽北“海上*** 游击队 ”为骨干，组建“福建海上保安第一总队”(亦称“纵队”)，并大力收罗土匪、流氓和地主武装约3000人，集结川石等岛。民国38年8月连江解放后，主力撤到马祖列岛，总部设西犬岛，成为台湾当局控制马祖列岛的最早 军事 力量。同年9月后，台湾当局即派陆军第二○七师六二○团等驻守马祖，隶属台湾“警备司令部”。1950年后，相继改派第三三九师、独立步兵第九十二师、陆军第十二师等接防。1952年11月，马祖守军改隶 金门 “防卫司令部”，相继又有陆军第十八师、六十九师等接防。1954年1月改隶“海军总部指挥”。1955年3月，从大陈岛败退的陆军第八十四师进驻马祖。同年4月，建立马祖“守备指挥部”，直属台湾“ 国防 部”。与此同时，把海上保安整编为“***救国军”，纳入正规军序列(后调 金门 集训)。1956年7月成立军政合一的马祖“战地政务委员会”。1957年4月后相继有陆军第十七师及五十一师1个营进驻马祖接防，继又增派 高炮 第八团进驻马祖，总兵力达2万人。1965年5月，马祖“守备区”改称马祖“防卫部”，驻东引和大丘岛的海军亦归其统辖。1967年增驻轻装步兵第十师。1969年由台湾陆军第十军接防。马祖守军有1个军部、2个师，陆海空勤总兵力增到2.6万人。1979年后，兵力稍作整顿，增加炮兵部队。1985年缩编步兵。80年代末驻有1个军部、1个重装师、10个炮兵营、1个 高炮 团、8个步兵营，总兵力2.1万人。前沿澳口密布铁丝网、地雷和永久工事.
从1957年开始，马祖和金门一样，成了台湾***的最前线，严格实施 军事 管制，更经历过二十年 解放军 单打双不打的炮战时代。
