四、撤退
李世民在从辽东撤退的时候，强迫辽东的居民迁往唐的地域内。据《资治通鉴》和《三国史记》记载，大约有7万高句丽人被迫从辽东迁入唐。李世民在过辽河的时候，遇到了泥沼。动用了1万人填平泥沼后，唐的大部队才通过辽河。一些士兵因此在寒冬等待时被冻死。唐太宗很后悔发动了这场战争，说要是魏徵还活着，魏徵一定会劝阻他不要发动这场战争。魏徵643年病故后，唐太宗曾怀疑他与侯君集和杜正伦结党，而毁掉的自已亲自撰写的魏徵墓。忏悔后，李世民下令重建魏徵的墓并召见和奖赏了魏徵的遗孀和孩子。
十二月，在定州到并州（今山西太原）的路上，李世民病痈，在并州修养了几个月后才回到长安。回到长安后，唐太宗将一般政事交由了太子李治处理。
一些历史学者认为唐太宗在攻安市城时受了伤，但具体是什么伤，说法不一，朝鮮18世纪以后的诗文、笔记小说称唐太宗眼部受到了箭伤。受伤说法於史无据。
五、后续
据说，唐太宗撤退后，渊盖苏文更加不把唐放在眼里，并时常偷袭唐的边境。唐太宗多次要他停止对新罗的攻击，但渊盖苏文对此毫不理睬。646年冬，唐太宗宣布与高句丽断交并考虑再次攻打高句丽。
647年，唐的大臣指出虽然645年对高句丽的进攻不成功，但战争使高句丽进入饥荒。因此建议唐太宗小规模攻打高句丽使高句丽农民无法耕作加剧高句丽的饥荒。于是唐太宗令牛进达和李海岸从海上攻打辽东半岛南部，李世勣和孙贰朗从陆路穿过辽河袭击高句丽。据说这两支部队的袭击使高句丽蒙受损失。
648年，唐太宗派薛万徹和裴行方再次从海上攻击高句丽。古神感也在一边接应。李世民相信这些对高句丽的小规模袭击已消弱了高句丽的力量，于是准备在649年率30万部队摧毁高句丽。一些唐的官员指出发动这样规模的战争需要有一年的粮食储备，并需要建造更多的战船。由于剑南道（今中国四川、云南和重庆）一直没有卷入从隋到唐的讨高句丽战争，因此唐的官员建议在这一地区建造船只。唐太宗对此表示同意并派强伟到剑南道筹建船只，下令船造好后经长江、东海运到莱州。除此之外，越州（今浙江绍兴），婺州（今浙江金华）和洪州也负责建造一些船只。不过人们很快就意识到剑南道的人并不擅长建造船只，因此剑南道最后只负者提供建船的木材。这些木材被运到潭州（今湖南长沙）造船。649年，唐太宗去世，依照唐太宗的遗愿攻打高句丽的计划被取消。唐高宗继位后，唐对高句丽和百济又发动了一些战争。660年唐与新罗的联军灭了百济。不过直到668年，唐和新罗的联军才最终灭亡了高句丽。
