88式步枪主要由三家普鲁士兵工厂生产，分别为但泽（Danzig）、埃尔富特（Erfurt）和斯班道，在安贝格（Amberg）建立了一家小的巴伐利亚公司也在生产该枪，此外还有一些私营的承包商也参与生产，包括路德维希-洛伊公司、奥地利斯太尔和黑内尔。到1898年停产时生产数字如下：政府兵工厂
750,000
安贝格
425,000
洛伊
425,000
斯太尔
300,000
黑内尔
100,000总产量
1,675,000
88式步枪正式服役后很快就传出了许多关于炸膛的传言。火上浇油的是，一个叫赫尔曼·艾尔沃特（Hermann Ahlwardt）的柏林校长把责任推给路德维希-洛伊公司，他声称，洛伊公司贿赂了政府里的武器审查人员接受伪劣产品。而洛伊家族正好是犹太人，新的无烟发射药也是由洛伊家族拥有的工厂生产的。于是德国媒体利用了这些传闻，向政府发起责难，并把88式步枪讥讽为Judenflinte，即“犹太步枪”的意思。当时许多德国人都问，为什么不选择毛瑟来设计新步枪。
无论是否存在行贿事件，事实是88式步枪服役后确实暴露出一些缺点需要改进的，例如弹壳颈部在抽壳时容易断裂、膛压过大容易炸膛等等，于是出现了一系列的改进型：
88/·步枪（Gewehr 88/• ）：在1891年1月9日后定型，主要是加强枪管，改进弹膛前方的锥膛形状。
88/Z步枪（Gewehr 88/Z）：在1896年7月的改进项目，主要是采用新的膛线，阴线深度从原来的0.10mm增加至0.15mm，目的是为了解决枪管磨损严重和膛压过大容易产生事故。既有在已有步枪的枪管上改造膛线，也有重新生产的枪管。
88/S步枪（Gewehr 88/S）：在1903年德国军队开始采用S型尖弹，新的弹头直径为8.22mm（原来的圆头弹为8.1mm），因此从这一年开始，原本的88/Z步枪都要改造枪管膛线，以便能发射直径较大的S型尖头弹。
88/05步枪（Gewehr 88/05）：在1905年开始的改进，主要是在“S”型步枪上改进供弹机构。
88/14步枪（Gewehr 88/14）：与88/05式相同，但装配和外表处理都比较差。
即使经过多番修改，但88式步枪最终还是被毛瑟研制的98式步枪所取代。除了存在故障率较高的缺点外，88式步枪的另一个问题是这种曼利夏式弹仓不太好用：必须用弹夹装填，而且弹夹是留在弹仓内的，在打光弹仓前不能再装填。而新的毛瑟式步枪既可以用桥夹装填，也可以单发装填，这样在打光弹仓前随时可以重新填满。此外曼利夏弹仓底部开口，容易进入杂物导致卡夹。（“漏底五子”这个外号正是由此而来的）
不过直到1915年获得足够的98式步枪以前，88式步枪仍在二线单位服务或作为战略储备，并转给其他国家，例如土耳其、清末民初时期的中国和一些非洲国家。“汉阳造”步枪也是仿制自88式步枪的，在国内一些旧