MSG3采用了PSG-1的板机组，扳机扣力只有3磅，枪托是MSG90式的，可调整抵肩距离和贴腮高度。由于这个枪托的缘故，MSG3的样子很容易让人误会成MSG90。MSG3使用最新的只有少数的HK步枪上才有的新型瞄准镜座，但在机匣上也保留了爪式镜座的固定点。与常见的爪式快卸瞄准镜座不同，这种新型镜座在安装后就无法使用机械瞄具，如果要使用机械瞄具，就必须拆卸瞄准镜。
MSG3的拉机柄是采用G41的增强型机柄，外形似乎和普通的G3拉机柄一样，其实尺寸是稍为扩大的。另外在MSG3的右侧，可以看到抛壳口后方有一个整体式的弹壳偏置器，使弹壳不会向后抛到射手身上。