为了再造巢湖碧水蓝天的秀丽风光，巢湖市日前制定了从2008年至2020年《巢湖流域水环境综合治理实施方案》，计划投资288.65亿元，实施53个污染治理重点工程及项目，从工业、农业、引江济巢、生态、城市等7个方面，对巢湖流域的水环境进行全面综合治理。
巢湖流域内共有河流33条，分为7条水系，主要集中水域范围包括巢湖、六安、合肥等城市和庐江、居巢、肥东、肥西等6个县区，人口逾700万。近年来，人口集聚过快、生活污水增多等因素，造成了湖泊富营养化、大范围生态退化和城市环境质量的恶化。
该《实施方案》将从全流域着手，采取“湖内与湖外、内源与外源、工程措施与生态措施”三结合的方法，以工程措施为主，多管齐下，努力恢复和维护湖泊流域的生态平衡与良性循环，促进湖泊资源的可持续利用，实现人与自然的和谐相处。预计到2020年，巢湖湖体水质将达到并巩固在三类水质的标准上。