5.内分泌缺陷
通常是女性的内分泌机能出现问题，包括黄体功能不足、甲状腺疾病、糖尿病、男性激素过多或泌乳激素过高等等，均可能是反复流产的原因，此原因约占17%，临床上抽血检查激素便可概略了解。
6.免疫机能异常
这原因造成反复流产的比率最高，约占50%。受精卵须在母体子宫内着床成长，免疫学上，这是属于同种移殖的一种。因为受精卵一半来自于先生的精子，非太太自己所有，所以有些妇女体内会产生抗体，来攻击受精卵，使其受到排斥，无法生存于子宫内，以致流产。此种情形牵涉到自己抗体及夫妻间组织是否合适之问题，必须进一步详细做免疫学检查，方能了解导致流产之真正病因。
7.生殖器官异常
如子宫畸型与子宫颈闭锁不全。子宫畸形包括先天性双子宫、弓状子宫、中隔子宫或子宫颈无力等，或是后天性子宫颈无力、子宫内膜粘连、子宫肌瘤、子宫腺肌瘤等，此约占反复流产原因的12%。在月经后接受子宫输卵管摄影检查即可了解子宫是否正常或有畸形。
心理及身体的伤害：包括工作繁忙、紧张压力、使用药物、胎盘异常、合并内科疾病、精子异常、卵子不新鲜、受精时间不恰当、过分激烈运动等许多原因亦可导致流产，此原因约占10%。
