某高校的相关人士对《每日经济新闻》记者表示，正方软件确实存在着一些问题。例如，在数据准备和导入时，所有的数据表结构一目了然，存在很多不清楚的扩展字段，还有一些同一字段多次出现在一个表中，类型和大小也不相同，“我想可能是针对各个高校的需求单独做的，维护起来比较麻烦。”该人士指出。
北京某高校学生在接受《每日经济新闻》记者采访时也表示，该高校就是在用正方软件，使用中暴露了许多问题，比如登陆的人一多就死机，系统并不智能，经常出现选错课、一门课选两次，数据库还经常出错等。
对此，有业内人士指出，逻辑关联不紧密，管理控制不精确，无法保证数据的正确性与数据状态的准确性，因而不可能满足教务工作对大量数据进行精确管理的需要，这也正是多年以来不少教务管理软件纷纷退出市场的原因所在。
招股书多项内容被质疑
据《每日经济新闻》记者了解，不仅是举报资料，正方软件在招股说明书中所提到的产品质量、市场份额等内容均遭到了质疑。
相关资料显示，正方软件早在十多年前是依靠卖办公耗材、电子产品而起家，目前是国内主要的高校管理软件供应商之一，凭借5.8%的国内市场占有率，位居业界第二，仅次于东软集团。在当前全国4169所高校当中，有75%左右(3100家左右)使用了教学管理类软件，而正方软件高校客户数量累计达到845家，正方软件在该领域的市场份额超过25%，上述数据均来源于赛迪顾问在线的 《中国高校管理软件行业市场研究报告》。
于是在外界普遍质疑正方软件吹嘘其在高校教学管理类软件领域市场占有率的同时，也将赛迪顾问推向了风口浪尖。赛迪顾问相关人士昨日对《每日经济新闻》表示，该数据报告确实为赛迪所做，但公司目前不便接受有关此事件的任何采访。
《每日经济新闻》记者注意到，正方软件声称高校客户数量累计达到845家，但对于外界传出的越来越多高校用户已经停止使用正方软件，目前公司到底有多少实际用户，正方软件并未作出说明。
此外，招股说明书显示，正方软件宣称其员工人数是309人 (截至2009年12月31 日)。然而该公司网站上发布的全体员工参加2009年度工作总结暨表彰大会的合影照片(拍摄于2010年2月23日)中只有220余人。不到两个月时间，正方软件的员工人数竟少了近百人，这不能不让人怀疑招股说明书中虚报了员工人数。