个体工商户从事运输业有非机动工具运输业和机动工具运输业。非机动工具运输是指以人力、帆船等简单的工具和设备运送货物和旅客。机动工具运输主要是指以汽车、拖拉机、机动船等从事客、贸运输。
使用机动车、船从事客、贸运输的须经县级以上交通部门检验合格，并办理过户、登记、发牌证手续；驾驶人员必须按有关规定进行考试、考核，取得行车、行船执照。在取得行车、行船执照后，方可向工商行政管理部门提出申请并附体格检验，检查批准后，可予登记营业。
此外，还应注意以下规定：
国家允许个体工商户购买机动车辆和船只经营运输业，个体工商户既可以从事客运也可以从事贸运；
从事运输业的，必须办理第三者责任保险和船舶保险，从事客运的，还必须办理旅客意外伤亡保险；
经营运输业的，必须遵守国家的政策法令，服从交管部门的管理，依法缴纳税款和费用；
个体工商户经营运输业，受到国家法律保护，任何单位和个人都不得向其乱收费、乱罚款，经营者有权维护自己的合法权益不受侵害。
