2004年1月14日出版的《21世纪经济报道》发表了中国管理科学研究院科学学研究所武书连、吕嘉、郭石林的2004中国大学排名。清华大学以232.56分名列第一，北京大学、浙江大学分别获得第二、第三名。进入前10名的大学还有复旦大学、华中科技大学、南京大学、武汉大学、吉林大学、上海交通大学、四川大学，其中四川大学是首次进入中国大学前10名。
《中国大学评价》课题组还评出了15所2004年中国一流大学，其中天津大学以工学第6名首次进入《中国大学评价》的中国一流大学。
《中国大学评价》课题组同时完成了理学、工学、农学、医学、哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、管理学等十一个学科门类的排名。清华大学获得工学第一名，北京大学获得理学、哲学、法学、文学第一名，中国协和医科大学获得医学第一名，中国农业大学获得农学第一名，中国人民大学获得经济学第一名，北京师范大学获得教育学第一名，南京大学获得历史学第一名，西安交通大学获得管理学第一名。
课题组也对中国大学258个本科专业进行了排名，北京大学、清华大学的本科专业第一名数量遥遥领先于其他大学。
参考资料：sohu http://learning.sohu.com/6/0104/17/blank***********.shtml
2005年高校前20名排名：
清华大学
北京大学
浙江大学
复旦大学
南京大学
武汉大学
华中科技大学
上海交大
吉林大学
中国人民大学
南开大学
西安交大
中国科技大学
中山大学
中南大学
哈尔滨工业大学
四川大学
北京师范大学
天津大学
山东大学
参考资料：http://edu.tom.com/zt/dxphpx/index.html
1.清华
2.北京
3.浙江