酷派D539配有手写笔
屏幕的上方除了醒目的天翼LOGO和手机听筒，并没有发现光线和距离感应器，也没有前置摄像头，光线和距离感应器还是很实用的，接听电话的时候酷派D539的屏幕不会自动关闭，也不会根据周围的环境自动调节屏幕亮度。
屏幕上方特写
在屏幕的选择上，酷派D539使用了和苹果3代比例一样的3.5寸屏幕，3:2的长宽比例使得屏幕看起来比较大，320×480的分辨率不算高，但也没有明显的颗粒感，遗憾的是酷派D539的屏幕并不支持多点触摸，普通TFT材质的可视角度也不是很好，好在屏幕亮度方面表现不错，在户外使用能够清晰的显示。
酷派D539的3.5寸屏幕
户外显示效果
D539并不是酷派的第一台双网双待手机，酷派之前上市的多台双网双待智能手机为D539的推出奠定了很好的基础，使得酷派D539的双网双待功能很完善。无论是信息界面还是拨号界面，都做到了一目了然、方便快捷，用户可以根据自己的需要，关闭或者启用任意一张卡。如果SIM卡没有包数据流量的话也可以禁用G网数据业务。
手机卡选择
在移动网络设置中，有CDMA网络和GSM网络两个设置，用户可以根据自己的需要设置是否启用数据漫游和CDMA网络偏好等内容。Android系统的下拉菜单中也有网络选择快捷方式。