游戏公司测试虚拟现实第一人称射击游戏时，测试人员意外死于游戏中——被一个非游戏角色的虚拟人物杀死。Mulder和Scully全副武装进入游戏调查真相。
第14集 夺命魔咒 Theef
誉满业界的医生曾经为一名无治疗希望的病人实施了安乐死。病人的父亲认为医生是杀手，决心用巫术报复医生全家。
第15集 尔虞我诈 En Ami
CSM利用Scully达成他的目的，在Scully和CSM的合作过程中，她多少了解到了他的另一面。
第16集 贤妻良母 Chimera
善良能干的妻子对丈夫偷情视而不见，宁愿默默忍受也要维护家庭的幸福。但忍受到了极限就一定会爆发，她变成了连自己都不认识的怪物。
第17集 人生旅途 all things
Mulder匆匆赶去英国看麦田怪圈，Scully留在华盛顿遇到了自己的旧情人，让她有机会对自己做出的选择进行了深刻的反省。
第18集 超级烟草 Brand X
Morley烟草公司利用转基因技术培育新品种烟草，却意外改造出了致命的烟草甲虫。Mulder成为了甲虫的受害者，生命垂危。
第19集 好莱坞式Ｘ档案 Hollywood A.D.
Mulder和Scully发现了耶稣让拉撒路复活时使用过的陶土碗。好莱坞把他们的经历拍成了电影，请Skinner担任副制片人。
第20集 斗阵俱乐部 Fight Club
通过捐献精子由同父异母所生的一对完全相像的双胞胎相遇，周围的人们便会莫名其妙地陷入疯狂。两对这样的双胞胎在全是摔角迷的摔角赛场相遇……
第21集 三个愿望 Je Souhaite
来自法国的古老的地毯精灵被释放了，她能满足任何释放她的人任意三个愿望。
第22集 安魂曲 Requiem
Mulder 和Scully回到他们第一次合作办案的厄勒冈，调查当地一起飞船坠毁事件。CSM自从手术后就身体欠佳，听到消息异常兴奋，认为是复兴计划的机会，派出 Krycek寻找飞船。MS发现，曾被劫持过的人现在又开始一一失踪了，他担心Scully的安全。但是，最后被飞船和赏金杀手带走的却是Mulder。 Krycek无情地杀死了CSM。Scully怀孕了。