第89集：研究报告！湖的传说！
第90集：放学后是幽灵时间！？
第91集：最后的大胜负！宠物小精灵铁人三项！！
第92集：回归原点的火箭队！？
第93集：跳的拳击练习场领导人！梅丽莎登场！
第94集：电栗鼠发烧了! 两人来看护!?
又译作：帕奇利兹发烧了! 两人来看护!?
第95集：小精灵华丽大赛－神巫大会！
第96集：银河团的袭击！！(前篇）
第97集：银河团的袭击！！(后篇）
第98集：漂浮的未知怪物！？（电视剧剧情介绍网 http://juqing. 全国电视节目预告）
第99集：四天王阿柳！相会与离别之森！
第100集：草苗龟、树林龟…然后是土台龟！（小智的树苗龟进化为树林龟）
第101集：劲敌训练家·阿顺登场！！
第102集：缘之道馆战！对抗梅丽莎！！
第103集：混战混乱 水脉市！
第104集：美梦神对抗噩梦神！（小光的小山猪进化为长毛猪）
第105集：羊羹与电磁怪！
又译作：羊羹与洛托姆！
第106集：与神奇宝贝友好相处之道！？（小光的长毛猪进化为獠牙猪）
第107集：战槌龙对抗护城龙！！
第108集：水脉道馆战！钢铁的对战！！
第109集：迷路的小吼吼鲸！
第110集：阿玄与路卡利奥！
又译作：建与路卡利欧！
第111集：钢铁岛的遗迹！
第112集：皮卡丘与圆企鹅，漂流记！
第113集： 恶作剧的菲奥娜
第114集： 口袋妖怪华丽大赛 通草大会!!
第115集：野蛮的君莎与搭档聒噪鸟！
第116集：暴风雪中的雪魔女！
第117集：火箭队解散！？
第118集：神奇圆环！天空大决战!!（小智的姆克鸟进化成姆克鹰）
第119集：激烈冲突！象牙猪对抗波士科多拉！（象牙猪开始听小光话）
第120集：教学！神奇的口袋中的宝贝!!
特别篇：不可思议的生物 神奇宝贝！
第121集：寂寞的雪笠怪！！（树林龟学会岩石攀登）
第122集：进化！这次是圆企鹅!?
第123集：神奇宝贝华丽大赛立浪大会!!
第124集：神奇宝贝乒乓球大会！加油，双尾怪手!!（双尾怪手离队）
第125集：樱花种子!坚强之战!?
第126集：训练家培育学园的铃奈老师！
第127集：切锋道馆！冰之对战!!
第128集：对战金字塔！真嗣对抗神代！
第129集：复活的雷吉奇卡斯！J再度登场！
第130集：电龙列车！“好看”登场!!
第131集：全员对战！真司对抗小智!! -前篇-
第132集：全员对战！真司对抗小智!! -后篇-(小智的小火猴进化成猛火猴）
第133集：由克希之影！（电视剧剧情介绍网 http://juqing. 全国电视节目