1987年的一个星期天，在读高中二年级的17岁小朔(山田孝之饰)去参加老师的葬礼，当同班同学广濑亚纪(绫濑遥饰)站在雨中坚持为老师致悼词时，小朔看着雨中的亚纪有着一难以言表的心情，不知不觉走到亚纪身后为她撑伞。这是他与亚纪的开始；
亚纪作为感谢送给朔一个电台获得的奖品——吉他钥匙坠。小朔知道了亚纪有给电台寄明信片，只为了获得电台送出的录音机。而此时，好友中川(柄本佑饰)一直暗恋亚纪，为了讨得亚纪的欢心，让朔代写明信片寄给电台。亚纪在无奈下接演班级话剧的朱丽叶角色，小朔看出亚纪的不情愿，同时也看到一个真实的善良的亚纪,于是便以罗密欧的化名以一个虚假的白血病女孩的故事替和尚写了明信片，虽然获得了录音机，却被亚纪看穿，亚纪怒斥朔的不负责任和他的谎言。朔将自己的心里话和道歉用录音机录下给亚纪，亚纪又录下自己的心里话给朔。于是，他们向彼此表白，朔与亚纪间纯纯的爱情就这样开始了。那天刚好是亚纪的生日，1987年7月2日，亚纪的生日却是她的最后一个生日。
《在世界中心呼唤爱》分集介绍：第二集 微妙的距离
2004年。朔太郎依然记得那天亚纪的笑容，手里握着保留了17年、有亚纪骨灰的小瓶子。他不知道自己是否要在没有亚纪的日子里过下去？他认为自己应该忘记她。于是他悄悄回到故乡，找寻与亚纪拥有共同回忆的地方……
1978年。朔开始与亚纪用录音带录下声音交换日记，他们的感情也发展的顺利。一晚，朔的爷爷 (仲代达矢饰)拜托朔帮忙去偷自己心爱女人的骨灰回来，并希望在他死后把她的骨灰和自己的一起洒在风里。朔坚决不肯帮忙。后来亚纪在爷爷的照相馆中看到一张泛黄的女人照片，才揭开爷爷年轻时的一段至今难忘的恋情。原来爷爷要偷骨灰的女人就是照片中的人，爷爷曾与他发誓要在一起，结果那女人却在嫁人后早早离开人世。朔与亚纪被爷爷的故事深深感动。亚纪鼓励朔去帮爷爷圆了心愿，去偷骨灰。
此时，班上正为亚纪选择演出罗密欧的男生，朔不想让别人眼罗密欧而去吻亚纪，便自告奋勇演出，结果亚纪选择了班长。在图书室朔撞见班长吻亚纪的一幕，他很气愤地与班长打架，结果在老师那里亚纪却为朔与班长的打架而撒了谎。这让朔不理解，他不知道自己在亚纪心中到底算什么。在他们交往后有了第一次争吵。
朔决定和爷爷去盗墓，偷爷爷心爱女人的骨灰。看到爷爷手握着心爱人的骨灰，又感动又伤心地流着泪，虽然朔还不是完全理解爷爷当时的心情，却被爷爷深深感动着。
在回家的路上，他不知不觉来到亚纪家门前。此时亚纪与朔交换录音带日记的事情被亚纪爸爸(三浦友和饰)发现，亚纪很生气，在垃圾桶中找回了录音带，正要爬窗子去找朔时，看到朔正好站在窗外。他们来到亚纪的秘密花园，山中一处开满粉紫阳花的地方。朔拿出和爷爷偷来的骨灰，并说出感人肺腑的真心话。在那里，、那时，朔第一次亲吻了亚纪。
《在世界中心呼唤爱》分集介绍：第三集 永远的离别
2004年 朔来到紫阳花盛开的地方，那个只属于他和亚纪的秘密花园，依然想着当时的自己和亚纪。此时，为了找到从医院悄悄逃跑的朔，小林带着儿子树来到朔的故乡，在朔的家门前遇到了正归来的朔。朔带着小林来到自己久别的家中，朔的父母依然用着以前的口吻和朔聊天，但朔知道他们故意避开17年前的某个话题。朔深感父母的良苦用心。朔看到自己小时候爷爷拍的照片，思绪又回到了17年前。
