在没选中金日成之前，金日成并没有在北朝鲜活动，还依然在苏联，25集团军把金日成推荐给斯大林之后，斯大林同意了，于是在1945年的9月份，苏联派了一艘名叫普加乔夫号的船，把金日成和他的一些亲信人员，大概有几十名，送回了北朝鲜。
这个时候的金日成可并不象后来那样，在北朝鲜的声望如日中天，当年他的声望很小，远不及曹晚植。苏联军政明知金日成无法与曹晚植卓越的领导力相比，便对其施行怀柔政策加以利用，背后却操纵金日成，促使金日成上台。
为了能让金日成顺利登上领导地位，以后能够按照自己的意愿办事，25集团军采取了一系列的措施。支持金日成的GCD并谋划暗杀了曹晚植的亲信共产党员玄俊赫，又支持金日成并操纵当众开始进行经济的收缴行径，其中第一个便是“粗粮收买事业”，曹晚植强烈反对这种收缴行为，对苏联军政府更是心存不满。曹晚植一方面反对这种经济收缴行为，一方面开始从正面反对信托统治案，开始了政治上的反苏活动。
苏联军政意识到对曹晚植施行的怀柔政策宣告失败，于是紧接着着手进行针对曹晚植的肃清。苏联政治司令官罗玛连科对曹晚植进行了最后的怀柔劝说，他对曹晚植说，“如果朝鲜施行了信托统治，你就是朝鲜的斯大林；但是，如果你不支持信托统治，我们将不能保证你的安全”。曹晚植却不为之所动，始终坚定自己政治信念，毫不犹豫地拒绝了罗玛连科。
1946年1月4日，金日成在苏联军政的指使和操纵下，组织召开了“五道行政局委员会”，会议主题即是推翻曹晚植的反托议案，GCD一方16人全部参加会议，而曹晚植的民族阵营一方仅有6人参加会议。会议进行了表决之后，曹晚植被迫辞去了委员长一职。金日成依据多数决议达到了自己的目的（确切的说应该是苏联人的目的），迫使曹晚植递交了辞呈，但是，曹晚植并没有因此而屈从于GCD的怀柔与胁迫。
1946年1月5日，也就是“五道行政局委员会”召开的第二天，结束会议的曹晚植被苏联警备队员包围，其亲卫队也被解除，曹晚植被胁持到车上，苏联政治司令官罗玛连科的最后警告也得到了应验。曹晚植先是被监禁在平壤高丽宾馆，之后被转移到寺洞，拘禁在过去日本海军曾经居住过的房子。
6月25日之前，金日成一派提议和南朝鲜一方交换人质，将李舟河、金三龙和曹晚植父子进行交换，以此掩人耳目，欲趁势发动朝鲜战争。金日成朝鲜战争失败后，1950年10月中旬，曹晚植被北韩警备队员和政治保卫队员杀害，在其拘禁生涯中，曹晚植一次也没有屈服过。
1970年韩国授予曹晚植“建国勋章”。1991年曹晚植用过的研钵被埋在韩国国家墓地。汉城和坡州有其铜像。在朝鲜有叫跆拳道“古堂”的一式，即为纪念曹晚植。但在80年代被“主体”取代。2008年10月17日下午，已故曹晚植（号古堂）逝世58周年纪念仪式在汉城明洞的YWCA大讲堂内举行。
