1995年11月底，大陆军队在福建东山岛外海进行登陆演习时，就曾发现1架以超低空飞行的侦察机，当时大陆军舰上的雷达还曾加以“锁定”，甚至已可辨识至架侦察机是由台湾一路低空飞过来的，但由于两岸还不到“非打不可”的地步，所以大陆军舰并未做出更进一步的动作。但据了解，该侦察机的确是台湾空军12队的rf-104g侦察机。
独立第12队是台湾唯一能执行战术侦照任务的部队，不管是针对大陆在沿海的各项军事调动，还是监视大陆的舰队动态，12队对于台湾都有战斗价值。
侦察机逐渐被卫星替代
1990年9月20日，f-104g侦查机２架，与第３、第11飞行大队掩护机共计８架，进入大陆领空进行侦照，侦照目标是温州机场，但过程与结果在f-104退休后到现在仍是机密。然而这次的任务是己知最后的一次“跨海侦照”，之后的侦照行动范围，由大陆沿岸退至海峡中线，rf-104g也已退休，空军在f-16制机接收侦照挟舱之前，则是将f5-e改装为rf5-e侦察机，在f5-e的机鼻上加装照相机而成。
但基于两岸情势的缓和，自1985年4月开始，台空军侦察机已奉“国防部”命令，停止所有进入大陆领空的飞行任务，也就是说完全不再执行大陆内陆地区的空中侦照任务，避免因侵入大陆领空而引发不可收拾的政治困扰。
受限于政治环境与硬件装备，台空军已经无法顺利飞入大陆侦照，ikonos卫星的出现，为台空军解决了一大难题，由于卫星飞越目标区的轨道与时间是固定的，对方可以预先躲藏，所以侦察机在今天的战场上仍然占有一席之地。
