公牍，而且模仿张的书法几能乱真。因与张之洞朝夕相处，不免引用许多同乡。有一年，大理寺卿徐致祥奏参张之洞一摺，牵涉到赵凤昌的名字。清廷交两江总督刘坤一查办，刘查办摺内，说得张之洞样样都好，不过为顾全京官参奏的人面子起见，说赵凤昌不免有“揽权招摇”情节，将赵凤昌革职，永不叙用。刘坤一这种做法当然是为了保护张之洞，让赵凤昌担责任，张之洞觉得很过意不去，就向盛宣怀讨了一个武昌电报局挂名差使给赵凤昌，作为生活之资，而派他住在上海，办理通讯、运输和其他机密事务。
谋划东南互保
1900年，义和团在北京围攻东交民巷外国使馆，枪杀德国公使，慈禧太后宣战上谕通电各省时，张謇、赵凤昌、盛宣怀等人在上海出谋划策，分头游说两江总督刘坤一、湖广总督张之洞、两广总督李鸿章，倡议拒绝上谕，保护东南。
张之洞起初迟疑不决，赵凤昌派人赴武昌面陈，又向张发电报说：“李鸿章、刘坤一在原则上已完全同意，而英国驻上海总领事，亦由盛宣怀接洽谈妥，只希望武昌方面出而主持。”于是，张与刘、李联衔通电各省将军、都统、总督、巡抚，电称：北京义和团作乱，完全由于端王、刚毅所指使，蒙蔽两宫，袭击各使馆，擅发对各国宣战之上谕，均不能承认，望各省当局切勿轻信，竭力维持地方秩序，保护外人生命财产。
超越南北党见的政见
上海光复后，位于南阳路十号的赵宅“惜阴堂”，成了各派要人聚会之所，赵凤昌与官僚、士绅、同盟会、光复会各方人士皆有往来，他思路开阔，智谋超群，对南北形势，判断精确，常出奇策，以匡时局。
在《赵凤昌藏札》第一百零七册函电稿中，有他拟定的政见五条：“保全全国旧有疆土，以巩固国家之地位。消融一切种族界限，以弭永久之竞争。发挥人道主义，以图国民之幸福。缩减战争时地，以速平和之恢复。联络全国军民，以促共和之实行。”这五条政见高瞻远瞩，超越了南北党见。
他在“目前所当研究之事”的备忘录中写道：“总机关宜如何组织。一切建设，宜如何预备。同人意见，宜如何发表。已独立未独立各省，宜如何交通。满洲政府如仍存在，宜如何应付。北方军队如袁世凯、张绍曾等，宜如何联络。”
他还草拟了“组织全国会议团通告书稿”：“自武汉起事，各省响应，共和政治，已为全国舆论所公认。然事必有所取，则功乃易于观成。美利坚合众之制度，当为吾国他日之模范。美之建国，其初各部颇起争端，外揭合众之帜，内伏涣散之机。其所以苦战八年，卒收最后之成功者，赖十三州会议总机关有统一进行、维持秩序之力也。考其第一、二次会议，均仅以襄助各州议会为宗旨，至第三次会议，始能确定国会长治久安，是以历史必经之阶级。吾国上海一埠，为中外耳目所寄，又为交通便利、不受兵祸之地，急宜仿照第一次会议方法，于上海设立临时会议机关，磋商对内对外妥善之方法，以期保疆土之统一，复人道之和平，务请各省举派代表，迅速莅沪集议。盼切盼切。集议方法及提议大纲如下：甲、集议之方法：一、通告各省旧时谘议局举代表一人常驻上海；二、通告各省现时都督派代表一人常驻上海；三、有两省以上代表到沪，即先行开议，续到者随到随议。乙、会议之要件：一、公认外交代表；二、对于军事进行之联络方法；三、对于清皇室之处置。”此稿即为九月二十一日（1911年11月11日）苏督程德全、浙督汤寿潜、沪督陈其美通电各省公推代表赴上海组织临时政府电文的蓝本，此后定名的“各省都督府代表联合会”及辗转汉口、南京的“各省代表会议”已成南方独立各省公认的立法机构，其后南方民军制定法案、组织政府、选举总统，皆端赖于此。
