为了给杨靖宇报仇，一路军各部在杨靖宇牺牲后向日军发起近乎疯狂的报复，一时间，长白山区各个据点的伪边防站，警察署，频遭袭击，但同时也暴露了目标。
一方面军军长曹亚范深为自己未能冲破日军包围圈救出杨靖宇而自责，因此他率先率部向日伪发起报复行动。经过连绵血战，最后只剩下几十人。40年8月，在濛江龙泉镇附近，曹亚范被叛变分子枪杀。一方面军是杨靖宇亲手创建的部队，至此，其基干部队除少量投敌外，全部壮烈殉国。
陈翰章(满族)的三方面军在敦化突出日军重围，进入黑龙江五常，每天都在战斗，部队大量伤亡，至40年10月，日军从叛徒口中得到消息知道其越冬物资储藏地，全部物资被焚毁。最后陈翰章身边只剩10几名战士，在镜泊湖边的南湖头小弯弯沟被包围。将军临危不惧，站至最后一人，血撒镜泊湖，年方27岁。陈翰章牺牲后，三方面军最后20几名伤员被迫北上，与五军政委季青的小部队汇合，经过多次战斗，只有几个人活了下来，退入苏境。
二方面军军长金日成在头道溜河会议上曾于杨靖宇发生意见分歧，据说还发生过激烈争吵。他认为应该在危急时刻退入苏境保存实力，而杨靖宇则认为应该永远战斗在中国自己的土地上。会后，金日成率部退向中朝俄边境地区，和龙，安图一带活动。与同年11月带领经过重兵围剿剩下的100来人退入苏联。 至此，在南满坚持战斗的东北抗联第一路军除金日成部余部(朝鲜人为主，大多数成为朝鲜人民共和国开国元勋)和少部分投敌外，全部战死。第一路军高级领导除了二军军长金日成，和二军独立旅旅长伊俊山(满族)活了下来，其他全都壮烈殉国。
抗战胜利后的第二年，东北民主联军总部决定，将杨靖宇牺牲地濛江县改为靖宇县，保安村改为靖宇镇，以示永久纪念。人民在靖宇镇杨靖宇遗体埋葬处修建了靖宇陵墓，举行了追悼大会，并在群众强烈要求下，在墓前当场枪决了参与杀害杨将军的伪濛江县警务科长王士洪和伪警察大队长桑文海和告密者李正新、赵廷喜，为将军报仇雪恨。
抗战胜利时，我地下党组织寻找到了杨靖宇的遗首，恭送到东北烈士纪念馆暂时寄存，并隆重举行了公祭大会。 杨靖宇在北满活下来的老战友们并没有忘记他，原二路军政治部主任冯仲云等人几经寻找，终于在河南确山李湾村找到了杨靖宇的儿子马从云和女儿马锦云，得知杨靖宇将军全家在他离开确山后遭到国民党当局迫害，生活十分困难，他的母亲和妻子于解放前已相继在贫病交加中去世时，当即指示当地政府拨一千斤麦子送予烈士子女，并送将军的儿子马从云去开封念书。据伪《满洲国治安小史》记载：“岸谷一声令下：‘打死他!’随着机枪射手勾动了扳机，杨倒下了。”
