第16集- 追命恶魔 YOUNG AT HEART
Mulder 探员刚加入联邦调查局时接到的第一个案件是一件珠宝店抢劫案。他成功地将案犯John Barnett抓获归案。在本集故事发生时，John Barnett已经在4年前死于狱中。然而，Mulder探员发现有人想置他于死地，而这个人正是John Barnett。
第17集- 外星访客 E。B。E。
深喉通知Mulder探员和Scully探员，一架飞碟在伊拉克被击落，并正在秘密运往美国。
第18集- 神迹 MIRACLE MAN
一个年轻人拥有一伸手就治愈病人的神奇天赋。然而，那些经他治愈的病人，竟然开始接连死去。
第19集- 变形狼人 SHAPES
一个印第安保留地发生了一起谋杀案。被杀的印第安人被误认为是一只动物。Mulder探员和Scully探员发现这个人可能就是印第安人传说中的狼人，一种可以随意变化外型的生物。
第20集- 夜幕低垂 DARKNESS FALLS
华盛顿州立森林公园的一群伐木者失踪了，他们失踪的方式同一群在50年前失踪的伐木者如出一辙。Mulder探员和Scully探员前往调查，却发现自己被困在一座木屋里，而木屋外却充斥了夜晚时分出来活动的吃人昆虫。
第21集- 终结突变异种 TOOMS
基因突变人Tooms被精神病院释放了。他需要吃一个人类的肝脏，才能开始另一次为期30年的冬眠。Mulder探员清楚这一点，于是设计把这个杀人狂抓获归案。
第22集- 附身 BORN AGAIN
一个探长和他的前搭档被神秘的谋杀了。一个小女孩目击了这两起谋杀案。Mulder探员认为，这个小女孩是一位生前被自己搭档谋杀的前警察再次转世。
第23集- 双胞奇缘 ROLAND
一个研究高级推进系统的研究及后发生了一连串的谋杀案件。所有的线索都指向曾经精神不正常的清洁工ROLAND。Mulder探员和Scully探员发现，这个人有着极不寻常的背景。
第24集- 外星混血 THE ERLENMEYER FLASK
深喉给Mulder探员和Scully探员提供了一条非常含混的线索。追踪下去，Mulder探员发现了一项代号为“纯度控制”的*秘密研究计划，研究的内容是外星人与地球人的混血人。