第116集--真新镇，我回来了
小智回家了,家里多了一个意料不到的人迎接他们。应该留在内木博士研究所的小刚不知出了什么事,对过去表现不敢触及的异常态度。小霞推测小刚被内木博士甩了。这时火箭队又来攻击了,在大木研究所发生危机时,小茂出现了,他击败火箭队,还向小智挑战。
第117集--宿敌对决,小智对抗小茂
小智的皮卡丘败给小茂的伊布。从大木博士口中得知小茂已经出发旅行到西部,向城都联盟挑战时,小智决定也要向城都联盟挑战。就在出发前的践别宴餐会上,火箭队出现了。跟平时一样,火箭队最后又被大家的神奇宝贝赶跑…
第118集--若叶镇!!吹起开始之风的城镇!
空木博士误把火箭队的武藏当成乔伊小姐,傻呼呼的让武藏拿走小锯鳄。这只小锯鳄是明天要送给新人训练家的。小智深知事情严重,主动要求帮忙君莎小姐把小锯鳄抢回来。打倒火箭队以后,小智正式登记参加城都联盟。
第119集--投手的菊草叶
小智遇到若叶镇的新人训练家奈奈。奈奈向小智提出挑战,结果输得一踏涂地。火箭队看上奈奈,利用奈奈设下一个棒球陷阱,伺机抢走菊草叶和皮卡丘。奈奈知道上当受骗,遂和小智连手打倒火箭队。
第120集--赫拉克罗斯对抗大甲
赫拉克罗斯的森林突然受到大甲攻击。原来是火箭队贪图大甲森林的树汁，赶走大甲，使得大甲群往赫拉克罗斯的森林移动。为了恢复森林的平衡，小智打败火箭队，让大甲得已回到原来的栖息地。
第121集--顿甲之谷
小智等人来到一座山谷，遇见顿甲训练家衣其小姐。衣其小姐的顿甲有寻找玛瑙的能力，被财迷心窍的火箭队抢走。于是小智等人找到火箭队，双方一场激战。当然，火箭队自然是被打败了。于是衣其小姐找回了她的小顿甲，并且和小智做神奇宝贝战斗，以做答谢。
第122集--咕咕跟迷惑森林
迷惑森林有许多恶作剧的神奇宝贝,使进入森林的人们迷路走不出去。小智一行人也在森林中迷路。先是遇到小茂,被嘲笑一番,接着遇到怪婆婆铃金。跟铃金借来的咕咕是只能力不足的咕咕,根本没有能力带路。这时候又巧遇火箭队,跟火箭队打没多久,火箭队就被幻觉骗走了。紧接着换小霞发生危险。咕咕喜欢小霞,因而发挥潜力,带领小智等人走出森林。
第123集--美丽花的战斗之舞
小智一行人在东门镇遇到训练美丽花准备参加神奇宝贝表演大会的阿丽。火箭队追踪小智等人随后来到这个地方，想用表演发财，失败后又想重操旧业，偷走参加大会的神奇宝贝。当然，这个阴谋又被皮卡丘和阿丽的美丽花粉碎了。
第124集--线球大搜索线
火箭队的武藏、小次郎、喵喵以怪盗猫八自居，到处犯案。君莎带着警察神奇宝贝线球一起出动调查。小智等人刚好旅行到镇上，遂答应君莎一起逮捕神奇宝贝小偷。在小智和皮卡丘及君莎的线球协助下，火箭队又被打得落慌而逃了。
第125集--布卢的华丽生活
阿札拉镇是有钱人的高级住宅区。住在那里的布卢却老是很不高兴，还离家出走。小智等人因为找到离家出走的布卢，而被请入有钱人家里作客。在那里目睹了有钱人溺爱宠物的千奇百怪的行为。火箭队见布卢是难得一见的神奇宝贝，就发动烂计划想偷走布卢。哪知布卢却大发神威，和小智等人一同打跑火箭队。
