圣エルミン学园
剧情CG后主角一行发现他们来到了半年前的圣エルミン学园，之后冲进来一个女生告诉マキ内藤出事后，マキ冲了出去（マキ暂时离队），之后边逛一下学校边寻找マキ后，主角一行惊讶的发现不仅仅是时间上的差异，学园里的师生也发生了很大的改变。原本性格活发的冴子变得沉默寡言，而对学生很严厉的反谷教导主任竟然变得慈爱无比。而言行疯疯癫癫，成天埋头于恶魔学的研究，被视为学园第一怪人学生的黑瓜努也变得头脑冷静，言谈清晰。导致大家不得不开始相信自己的来到了一个和自己的世界相反的镜像世界，这里的一切都和原来的世界相反。然而事情并不是这么简单。
之后来到2F的2-5教室，见到了名叫内藤阳介（以下阳介）的男孩。转学来到圣エルミン学院以后，体育优秀，健康明快的他很快得到了麻希的爱慕。但是麻希的好友香西千里也喜欢上了他，麻希和千里的友情因此开始破裂。也让大家感到吃惊的是，内藤阳介主动说出了自己也不是这个世界的人，也是和大家一样，被突然带到这个世界来的。这时候，学园外传来黑衣的小女孩あき的声音，学园异界化。
マキ归队。她向大家坦白了自己并不是大家熟知的那个麻希，而是这个镜像世界里的麻希。但除此之外她也并不知道更多。而且，她完全不知道自己有母亲的事情。
之后来到异界化的エルミン学园2F美术室，大家意外地遇到了和邪鬼オーガ对峙的城户铃司(レイジ)，战斗中レイジ发动PERSONA轻松击败敌人。之后从美术室另一扇门出去继续前进并返回1F中庭，发现黑衣小女孩あき果然在这里。剧情后与外道テッソ战斗，电击弱点（マーク的初始P练到RANK8后会习得マハジオ，利用之），小心BOSS的グライバ（地震属中伤害）以及メギト（核热属性全体伤害），同样，如果有全体回复魔法的话很轻松，推荐JUDGEMENT LV18的ファレグ，该PERSONA在RANK5时能习得全体HP中回复的メディアラマ。战斗结束后黑衣小女孩消失，学校异界化解除。之后阳介出现，根据阳介的提示，前往3F图书室，与怪人黑瓜努会话。 （图书室里会看到实体化的「楽园の扉」，但现在不能进入）之后マキ提出前往アラヤ神社。
アラヤ神社
进入学校右上方的アラヤ神社后再次与金色の蝶、フィレモン会面。之后被告知要去寻找「破魔の镜」，之后前往御影乡土资料馆（位于学校上方地图），进入右侧展示室后找到了我们需要的「破魔の镜」，之后进入地图右侧的地下铁入口来到被隔开城市的另一边，在地下铁构内发生与邪鬼ヨグソトスJr的战斗，该BOSS弱技属性攻击，片手剑属性攻击，冰属性吸收，冲击属性弱，并且会使用睡眠魔法，保证HP一半以上稳扎稳打吧。战斗胜利后黑衣女孩あき再次出现，并告诉主角下次的对手会是女孩子。之后离开地铁站前往右边的ブラックマーケット。
ブラックマーケット
进入后暂时性的就不能外出了。在ビースダイナー了解到关于这里的统治者，女王ハーレムクイーン的事情。并得知女王很喜欢画画。之后赌场旁边的房间由此进入カーマ宫殿，坐电梯坐到B4F后，再走到,竖条显示的门后面掉到B5F，接着从B5F掉到B6F，再在B6F打开地图最右边那扇门掉入B7F，之后再从B7F掉入B8F，进入旁边的门看到千里的画。之后来到8F地图南方掉入B9F进入旁边房间（宝箱别开，全是陷阱）出房间后来到上方后进入右侧的门掉入10F，记录完毕后就可以来到女王所在的地方。在房间内见到了ハーレムクイーン，果然女王正是麻希曾经的好友，现在的情敌香西千里。而且她也不是这个世界的人。香西千里见到麻希又惊又怒，将众人转送回酒吧。在ブラックマーケット整顿好后再次前往カーマ宫殿B10F见到千里，她将自己一直以来对麻希的嫉妒全盘托出，不管是学园内的人气还是绘画，都比不过麻希，因此才横刀夺爱抢走了麻希喜欢的内藤阳介，借此来获得心理平衡。但是很快她发觉自己陷入了更大的不安，因为她始终觉得阳介喜欢的还是麻希，而自己什么也没有抓住。这时她遇到了黑衣女孩あき，あき将她带来这个不同的世界做了女王，她一时得到了很大的满足，但最后却发现自己最在意的还是不能胜过麻希这件事。至于她脸上的丑陋的黑痔，则是向あき给她的镜子许愿的代价：向镜子许愿一次，黑痔就会增加。但已经开始疯狂的千里不惜付出自己的美貌为代价。她将主人公和麻希以外3人石化，然后问主人公觉得谁的画更出色。
「クイーンの絵の方が上手い」减少以前挣得的封神具获得数目。但BOSS战时全员参战。
「麻希の絵の方が上手い」封神具获得数+1。主人公和麻希二人参战。
BOSS战ハーレムクイーン。疾风弱，会使用石化魔法，战斗前记得多准备点解石化的道具，如果有JUDGEMENT的LV18的ファレグ的话，可以边降她的攻击边恢复。保持HP一半就回复的话，BOSS的攻击根本威胁不到我们。
战斗结束以后，内藤阳介从镜子里出现。他已经通过镜子看到了千里所说的一切，但是他很坚定地告诉了千里，自己不是三心二意的人，自己现在真正喜欢的确实是千里。
而マキ也告诉千里，自己并不是有意给她带来那么大的压力，并原谅了千里的所为---虽然自己并不是千里熟知的那个麻希。千里喜极而泣，她再也不当ハーレムクイーン了，镜子破碎了。
战斗结束后离开カーマの宫殿准备前往黑衣女孩所在的マナの城
マナの城
来到ブラックマーケット上方地图就能看到マナの城，进入后见到黑衣女孩あき，在得知森林深处还有一个小女孩后，她逃进了城堡，而城门也锁得严严实实的。之后根据提示，我们需要先去大地图西侧的迷いの森找到半月型的道具才能使城门开启。
