这样一来，袁崇焕控制了毛文龙粮饷装备供给渠道，而且切断了他海上贸易的命脉。面对袁崇焕的咄咄逼人，毛文龙做出了激烈的反应，他向皇帝上疏说：这是“拦喉切我一刀”。此时的毛文龙似乎也预感到了处境的危险，向皇帝抱怨：“诸臣独计除臣，不计除奴，将江山而快私忿，操戈矛于同室”。
袁崇焕的做法最终由于毛文龙的激烈反对而作罢，但是毛文龙与袁崇焕间的矛盾至此已经十分尖锐了。
毛文龙的负面效应
毛文龙对于后金的牵制作用和其在抗金斗争中的贡献应该说是有目共睹的，然而，他终究是个狂妄重利的家伙。谁的面子都不想给，俨然土皇帝雄霸一方、野心昭昭还在其次，在辽东前线军饷最紧缺的时候囤积物资发战争财，这才更恨人。而毛文龙和皇太极的议和与袁崇焕的假议和性质也完全不同，前者是利字当头为求自保真假自知，后者是为了巩固战线拖延时间。
毛文龙堪称一代枭雄，但绝对不是什么气节高尚的真英雄，他过于重利且野心勃勃，这样的人控制不好，岂不是国家大患？
眼里揉不得沙子的袁崇焕这才有了“毛文龙可用就用，不可用就杀了他”的杀毛之心。