1619年，巴达维亚城建立，这使荷兰能
够把它在南洋群岛的主要军事力量和商业活动集中到一个有利的地点。正是从这个固定地点和“香料群岛”出发，荷兰编织起庞大的商业交换网，并建立起他们的海外领地。
1622年，在亚洲羽翼渐丰的荷兰人又恢复了对中国沿海的攻击，试图征服澳门。葡萄牙人的一发炮弹恰好射入荷兰人的火药桶，葡萄牙人及其奴仆一阵猛烈的冲锋，突入荷兰人登陆的海滩，荷兰人被击退了。攻击失败后，船队离开了澳门，并于7月占领澎湖列岛。
在现场的荷兰军官很快就意识到他们不能像威吓东南亚海口小王国那样来恐吓明帝国，但荷兰巴达维亚当局迟迟不能明白这一点，持续催促在澎湖的荷兰人扩大战果。1624年2月初，载有5000多名明帝国士兵的40－50艘帆船渐渐在澎湖列岛北部集结。到1624年末，荷兰人全部从澎湖撤出，并开始在现在的台南地区落足。荷兰人终于接受了中国人早在1604年第一次向他们提出的解决办法。
如果没有与印度的联系，任何人在南洋群岛都不能立足，因为印度控制着从好望角到马六甲和马鲁古的南亚经济世界。荷兰人注定要前往印度的港口。在苏门答腊等地，贸易通常以胡椒换取印度布的方式进行，荷兰不能让自己始终经人转手购买科罗曼德尔或古杰拉特的布匹，并且必须用现金付款。
荷兰人因此早在1606年就来到苏拉特（印度最大的港口），尽管他们在苏拉特的房屋设施只是于1621年方才竣工。1616至1619年间，他们在布罗奇，坎贝，艾哈迈达巴德，阿格拉，布尔汗布尔分设了商行。后来，他们又打开了马拉巴尔的市场。
1638年，幸运之神开始大规模地眷顾荷兰东印度公司。那一年，荷兰人在盛产桂皮的锡兰立足，并渐渐成为这个觊觎已久的岛屿的主人。
同一年，日本驱逐葡萄牙人，并禁止所有日本人出海航行，但仍向荷兰东印度公司的商船开放。在中国台湾的荷兰人开始品尝此前为葡萄牙人独享的与中日两国贸易的果实。贸易迅速扩展，从1637年后期至1639年早期的19个月，荷兰得到了价值100万银两的中国货，其中不少是用日本出产的银来支付的。直到明清间的战争使中国的生产和贸易崩溃之时，荷兰经手的贸易额一直保持在这一规模。
1641年马六甲陷落。葡萄牙在亚洲的领地开始分崩离析。巴达维亚的地位至此如日中天，并维系了半个世纪之久。
荷兰人在其巅峰岁月里的驾驭能力第一次让世人目睹了世界市场的魅力。在东亚，如果说16世纪是葡萄牙人的世纪，那么17世纪则明显是荷兰人的世纪。
