Ki-45 第二架原型机的发动机舱进行了重新设计，但仍不理想
在三架原型机完成后，陆军又追加了 6 架原型机的定单。1939 年底 Ki-45 原型机达到的最大速度是 480 公里/小时（4,000 米高度），追加的6架原型机处于不同的制造状态，c/n 4504~c/n 4506 已经安装了中岛 Ha-20 乙发动机，c/n 4507~4509 则刚完成机体。为了彻底解决引擎舱乱流的问题，川崎建议头 3 架原型机使用反向旋转螺旋桨取代同向螺旋桨。这种改装在当时看来很有希望解决机翼失速的问题。由于动力不足，3 架原型机始终无法达到设计速度，陆军决定重新审核该项目，并指示川崎在审核完成前限制试飞，因而反转螺旋桨的改装始终没有进行。
