P99需更换枪管才能安装消声器
普通的P99不能安装消声器，但瓦尔特公司为9×19mm P99生产了在枪口有螺纹的枪管，这些枪管上没有打上序号，但打上一个两位数的日期代码和“SD”标记，“SD”是德国语“消声”（Schall Daempfer）的缩写，换上这些枪管的P99就能安装螺接式的消声器。瓦尔特公司没有为.40 S&W P99生产SD枪管，但在美国有一些小作坊生产有.40 S&W口径的SD枪管。
P99的瞄具可调风偏和高低，不需要工具就能拆卸或更换，因此用户可根据自己的需要或爱好来选用较大或较小的瞄具。瞄具既有钢制也有聚合物制品的。
两种口径的P99都有以下几种主要型号：
P99AS——单/双动型，这是基本型。
P99DAO——纯双动型，是为德国警察试用而提供的型号，在2002年推出，不幸的是并没有它进一步生产的消息。
P99QA——QA型，在2000年推出，采用行程较短、扣力较轻的半双动扳机，并有手动待击击针。
P99C——紧凑型，在2004年推出，尺寸较小、重量较轻，容弹量也减少了。目前紧凑型只有9×19mm口径，但都生产了AS、DAO和QA三种型号。
P990——其实就是原来的P99DAO，改了名字后重新推出市场。
P99TA——TA是战术型的缩写，在2004年推出，明显的特征是底把前方的导轨座形状有所改变，能安装更多市面上的通用战术附件。
P22——名称不同，但其实是P99的.22LR口径型。P99不像其他手枪那样提供.22LR口径的改装配件，如果想要.22口径的练习枪，只能买一支新枪，这也是P99受到用户诟病的一个缺点，诸如伯莱塔等著名手枪都提供有.22口径的改装配件，让用户可以成箱成箱地消耗便宜的.22弹作基础练习。
