第四十集 纽约香港大混战
帝皇龙甲兽将大家送到该去的地方后，到指定的地点退化。大辅来到纽约见到美美和加来的复制人，其他被选中的孩子则将数码暴龙带到指定的地方。祖利兽突然发狂，花仙兽、V仔兽EX以及其他被选中孩子的数码暴龙一起攻击，终于制服了祖利兽。大辅打开数码大门，将数码暴龙送回了数码世界。在香港，光子郎和小光见到拥有八爪鱼兽的三兄弟，准备在九龙公园将由亚洲被选中的孩子送过来的数码暴龙送回数码世界。但是在穿越中国国境时受到阻拦，大家想出办法证明数码暴龙们是有智慧的，终于安全通过。小光他们的任务也完成了。
第四十一集 珊瑚和凡尔赛大混战
阿丈和伊织来到悉尼破坏黑暗塔。突然见到被选中的孩子以及贝壳兽、龙虾兽和墨鱼兽，于是大家用“数码暴龙什锦海鲜攻击”吓跑它们，并追上去。突然，亚路加兽出现，为了防止它破坏珊瑚礁，海狮兽超进化成祖顿兽，与潜鲨兽一起打败了阿路加兽。巨蟹兽进化成的古尼兽破坏了黑暗塔，然后伊织打开大门将数码暴龙放回数码世界。巴黎那边，阿武、太一和阿武的爷爷发现凡尔赛宫有数码暴龙，原来是豆豆兽三兄弟。后来，还出现了炸弹兽。在打败它们后，机械暴龙兽和神圣天使兽破坏了黑暗塔，并将这四只调皮的家伙送回了数码世界。
第四十二集 恋爱和罗宋汤大混战
小贤与阿和来到墨西哥的玛雅遗迹，偷偷走了进去。途中遇到拥有矿石兽的女孩，虫虫兽感到小贤对它的感情会发生动摇。在遗迹深处发现了牛人兽和蜘蛛兽，它们逃了出来。出来后，兽人加鲁鲁兽、飞虫兽和矿石兽进化成的角龙兽将它们击倒，送回了数码世界。莫斯科那边，小京和小空由于不会讲俄语，便用食物作为号令来与俄罗斯的孩子一起作战，战斗完后觉得非常饥饿与疲劳。本来俄罗斯的孩子要请她们吃东西，却因为还有一些长毛象兽没收拾。此时帝皇龙甲兽带着孩子们及时赶到并打倒了它们。大家要立即回日本，因此小京和小空因为没有吃到东西而非常失望。
第四十三集 究极魔兽军团袭来
小贤睡觉时梦见自己被植入黑暗种子的情景，醒来后就埋怨自己为什么记不起以前的事。后来，女恶魔兽、海魔兽、丧尸撒旦兽出现在现实世界，孩子们的数码暴龙与它们苦战。最后，所有完全体数码暴龙被丧尸撒旦兽打倒，而帝皇龙甲兽也被封印住不能动弹。光子郎明白到亚古兽他们不适应现实世界的生活，于是它们将力量给帝皇龙甲兽后，回到了数码世界。帝皇龙甲兽变身成为战士形态，一击打倒丧尸撒旦兽。这时，究极魔兽出现，但亚基利兽却在所有人的眼皮底下以许多被绑架的孩子作威胁，带走了小贤……
第四十四集 与黑暗数码暴龙的死战
大家乘阿丈哥哥的车追亚基利兽的车。小贤在被绑架的孩子中，看到他爸爸的同事及川悠纪夫。原来他是亚基利兽和木乃伊兽的创造者，他想将小贤身上的黑暗种子移植到被绑架的孩子们身上。并且他就是小贤的哥哥死后发邮件给他的人。人面战鹰兽与女恶魔兽战斗，被打成重伤。小京为救被女恶魔兽捉住的人而被女恶魔兽攻击，人面战鹰兽为保护小京而打倒女恶魔兽。另一边，古神兽与海魔兽战斗，伊织和阿武到医院救人。经过苦战，古神兽打倒了海魔兽。小京和伊织都很矛盾，因为他们必须面对有思想和生命的数码暴龙。雷龙兽很快要追上绑架小贤的那辆车了，而究极魔兽也出现在那辆车面前……
