新近公开的宋档显示，随着蒋对史迪威傲慢和无知愈加恼怒，宋再一次游说华盛顿，试图撤换史迪威。在1943年9月29日宋对蒋密电中，宋报告说他已经和美国政府达成了几份重要的协议，包括“不惜以一切代价”来撤换史迪威。当宋陪同东南亚战区最高统帅蒙巴顿将军于1943年10月来到重庆时，他向蒋确认了这个“好消息”，并催促他立刻发电报给罗斯福。
但是蒋此刻再次改变了心意。考虑到史迪威和美国防部的深厚关系、他刚刚成为蒙巴顿将军的副手，以及中缅印度的战局，蒋仍决定留下史迪威。此时，宋感到莫大的羞辱和背叛。在10月中旬，蒋和宋两人大吵了一架。愤怒的蒋，据说把一只碗摔在地上，同样愤怒的宋，则重重地摔上门，离开了蒋的住所。
在后来的三个月内，宋形同被软禁在其重庆的住所里，不被允许参加官方活动，也不被允许回到华府，而且没有随同蒋介石参加开罗会议，尽管正是因为他在华府的努力，才使蒋得以参加此一峰会。1943年12月23日，宋以一种谦逊、克制和巧妙的方式写信给蒋：“两月以来，（文）独居深念，咎戾诚多，痛悔何及，窃文之于钧座，在义虽为僚属，而恩实逾骨肉，平日所以竞竞自励者，惟知效忠钧座，以求在革命大业中，略尽涓埃之报，而抗战以后，内心更加兴奋，无论在国内国外，惟知埋头苦干，秉承钧座指导，为争取胜利，竭其绵薄，无奈个性愚憨，任事勇锐，对于环境之配合考虑，任事每欠周详，甚或夙恃爱护过深，指事陈情，不免偏执，而流于激切，此诚文之粗谬，必赖钧座之督教振发，而后始足以化其顽钝，亦即文于奉教之后，所以猛省痛悔，愈感钧座琢磨之厚也。今文以待罪之身，诚不敢妄有任何渎情，一切进退行藏，均惟钧命是听。伏乞俯鉴愚诚，赐以明示，俾能择善自处，稍解钧座烦扰，则文此身，虽蒙严谴，尤必与青天白日，同其贞恒，惶悚上陈，伏祈垂察，敬叩钧安。”
这封信目前保留在宋的档案，见证了宋试图安抚蒋的努力。这封信有没有寄给蒋，吾人不得而知，但是宋于1944年春天起，恢复出席官方的活动。
蒋拒绝撤换史迪威并没有改善中美关系，他的犹豫极有可能让事情变得更糟了。1944年9月，蒋最后一次要求罗斯福召回史迪威。许多历史学家长期以来认为蒋史之间的交恶，在1943年以后是如此严重，以至于美国对蒋的恶感，在国民党撤到台湾、朝鲜战争爆发之前一直没有恢复。
