董一元，生卒年不详，明代宣府前卫（今张家口宣化）人。《明史》有传。
董一元是将门之后，其父董旸在嘉靖年间为宣府游击将军。当时，蒙古部族首领俺答进犯滴水崖，董旸力战至死，朝廷对其追赠嘉勉。其兄董一奎，曾任都督佥事，先后镇守山西、延绥、宁夏三省边防，以勇猛著称。
嘉靖年间，董一元任蓟镇游击将军。当时土蛮、黑石炭等部1万余骑兵进犯，总兵官胡镇率兵抵抗，董一元功劳最高，升任石门寨参将。隆庆初年，他在棒槌崖大破敌军，又是军功最高，升任副总兵，驻防古北口。万历十一年（1583年），董一元以都督佥事衔任昌平总兵官，不久移驻宣府。万历十五年（1587年）后，又移驻蓟州、宁夏、延绥等地，朝廷进封他为都督同知，兼中府佥事。
万历二十二年（1594年），董一元任辽东总兵官。当时，蒙古部泰宁速把亥被官军杀死，他的次子把兔儿时常想要为父复仇，而且势力日益强大。西部的卜言台周有部众10余万人，也与把兔儿东西相呼应，屡次侵犯边境，其他部也纷纷响应，进犯广宁。把兔儿以炒花、花大、暖兔、伯言儿的部队驻守旧辽阳，自己亲率大军入侵镇武、锦、义等地。董一元与巡抚李化龙商议进攻策略：“卜言虽然人数众多，但是与我们距离远，我特别忧患的是把兔儿及炒花他们。现在把兔儿部众不过1万余人，打败了他，卜言就会不战而逃。”于是就派遣副将孙守廉急赴右屯抵御西部卜言，而自己亲率大军埋伏在镇武之外，设空营来等待把兔儿的部队。敌人骑兵冲入大营，见是空营，就以为明军胆怯，纷纷大笑，于是放心深入。明军忽然从中奋起，冲锋陷阵，自午时战到酉时，敌军慌忙逃窜。此战，明军俘斩敌军540余人，获得马驼2000余匹。伯言儿中箭而死，把兔儿也受了伤，残余部众终夜慌忙逃窜。捷报传到朝廷，万历皇帝大喜，祭告郊庙，宣捷行赏，进封董一元为左都督，加封其太子太保衔，赐世袭本卫世指挥使。
伯言儿部最剽悍，诸部族倚仗他作乱。伯言儿被歼灭，其他部族士气大伤，有的部族开始向明朝称臣纳贡。把兔儿、炒花及卜言台周、瓜兔儿、歹青却暗暗积聚力量，企图重新进攻辽、沈地区。董一元率领精兵踏冰渡河，直奔敌军老巢，过墨山时，天降大雪，将士士气益发高涨。急行四百里，三昼夜之后到达，斩首120级，全师而还。把兔儿由于在镇武受到重创，郁郁而死，其部众也分散瓦解，诸部族纷纷向西远逃。
董一元以军功进封世袭二品官秩。后来因为疾病而回朝。董一元先后镇守边关要冲，军功卓著，与当时的麻贵、张臣、杜桐、达云并称边关虎将。
