布吉河为深圳河的上游，发源于黄竹沥，上、中段流经布吉街道中心区，下游进入罗湖商业区，在渔民村汇入深圳河。流域面积63.41平方公里，在龙岗区的流域面积为28.03平方公里，占布吉辖区面积的33％。河长21公里，多年平均径流量0.67亿立方米，支流有水径河、大芬河、塘径河等8条。流域内经济发达，人口密度达到4760人／平方公里。从20年前开始，这里逐渐变成深圳污染最严重的河流之一。布吉河，又黑又臭的布吉河，成为深圳人挥之不去的恶梦之河。
布吉河两岸违法建筑林立，厕所都建在了河堤上，垃圾、废物、粪便随意倒入河道，深圳河污染源的50％以上来自布吉河。
布吉河流域各污染源概括起来分为生活污染、种养殖污染、工业污染和垃圾污染四大类，其中生活污水是布吉河的主要污染源。随着流域内经济的迅猛发展和人口剧增，生活污水的排放量大幅度增加。据调查统计，2005年流域污水排放总量为18万吨／日，生活污水的排放量达到17.8万吨／日，占总量的98.9％。目前，流域内仅建有2座污水处理工程，由于配套的截污管网尚未动工兴建，只能抽取河水进行应急处理。在布吉河径流量小且自净能力十分有限的情况下，沿河两岸大量未经收集处理的生活污水直接排入水体，是造成布吉河水质恶化的主要原因。
布吉河流域内共有工业企业805家，有生产性废水排放的企业136家，其中日排污量在1吨以上的主要污染源有25个。
生活污染占河流污染负荷的九成以上，是影响布吉河水质的主要污染源，但由于在流域经济快速发展、城市建设突飞猛进的过程中，截污管网、污水处理厂、垃圾处理场等环保基础设施没有同步建设，致使生活污水、生活垃圾等主要污染源没有得到有效处理而污染河流。
