荣誉称号
1957年起被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，1988年起成为原上海第二医科大学教学医院，1994年被评为三级甲等医院。2004年成为上海市红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属胸科医院。医院先后获“全国卫生系统先进集体”、“上海市职业道德建设十佳单位”、“市文明单位”四连冠等殊荣。
医院设施医院设有12个临床科室和10个医技科室；核定床位580张，有病区17个。附设上海市胸部肿瘤研究所。
医院现有职工1000余名，其中正副主任医师105名、正副教授50余名、博
士生导师、硕士生导师18名、享受国务院特殊津贴28名。
建院以来，医院创造了多个“第一”。我国第一架鼓泡式人工心肺机的研制和应用；国内首创塑料无缝人造血管、毛绒型涤纶人造血管并应用于临床；自动快速心血管造影换片机及二尖瓣扩张器、动脉导管钳闭器的研制；国内第一株人体肺腺癌细胞株的建立；世界首例非血缘供体、成人单侧肺叶移植术；国内首例冠脉搭桥并行心脏瓣膜置换术；气管移植术、胸骨移植术以及各种气管术式的创新；并在国内医疗机构中第一个拥有高新技术转化园区及全国重点新产品证书。
重点科室目前医院开展的单肺、双肺移植术，冠心搭桥术，心脏单、双瓣膜置换术及瓣膜成形术
，各种心脏复杂畸形的诊治，各类肺、食管、气管、纵隔手术，各类心脏疾病的介入诊治，恶性心律失常和急性心肌梗塞的救治，气管镜的诊疗技术以及病理细胞、组织学检测等均居国内先进水平；肺癌的早期发现和综合治疗等居国际先进水平；还曾成功施行同种异体原位心脏移植术。建院以来，医院共施行各类心胸手术8万余例，心脏介入逾万例，每年收治的门急诊和住院病人逾15万人次，成功医治了数以万计的疑难重危病人。
医学研究医院曾先后承担“六五”、“七五”、“八五”国家级重点科技攻关项目及上海市首
批医学领先专业“胸心外科学”与“肺部肿瘤学”的研究；已获国家级、部级、市级等科技成果62项，科研奖项43项；获各类专利28项。目前医院正承担着国家重点学科、上海市肺部肿瘤学临床医学中心及上海市医学重点学科“胸外科”的建设；并承担着“十一五”、“863”等重大项目及多项国家、部、市、局级课题的研究。
医院已举办全国心胸外科进修班36期，每年承担多项国家级继续教育项目的培训任务。
科室设置心外科 心内科 胸外科 肺内科 临床中心 放疗科 中西结合科 小儿心外科 ICU 麻醉科 急诊室 体外循环室
院长简介冯运，硕士，教授，研究员。1984年毕业于第二医科大学医疗系，1996年毕业于上海医科大学社会医疗与卫生事业管理硕士研究生课程班。曾长期从事普外科、泌尿外科临床工作，具有丰富的临床经验，发表专业论文数篇。1994年起走上医疗管理岗位。1997起先后任医院党委副书记、纪委书记、工会主席、副院长，2001年12月起任院长。
冯运院长凭借其医学专业、管理专业双重教育背景和长期从事临床医疗和多年党政管理的经验，在管理中以宏观的思维确立医院的奋斗目标和医院改革与发展规划。他一手抓硬件、一手抓软件建设。一方面，他积极争取上级的支持，多渠道筹资投入医院病房大楼的建设；一方面狠抓学科建设和人才培养，在充分发挥老专家作用的同时，大胆启用中青年干部，积极扶持中青年骨干开展新技术、新项目。他还不断适应新形势，引入新型经营理念和管理手段，并从医院内科运行机制改革入手，建立健全管理考核体系及岗位考核制度，教育职工树立竞争意识、忧患意识和质量意识，以不断提高医疗技术水平和医疗服务质量，为病人提供及时、便捷、优质的服务。
作为医院法定代表，他自律严谨，以身作则，以己正人，影响带动整个班子乃至整个医院，以积极进取的事业心和胆略以及谦逊深入的工作作风，吸引、感染和激发着全院职工无穷的创造力。
