盘锦市湿地科学研究所的前身是中国轻工业部芦苇造纸局芦苇研究所，成立于1954年。1980年隶属辽宁省轻工业厅领导，为辽宁省芦苇科学研究所。2001年划归盘锦市领导，为盘锦市芦苇科学研究所，是以芦苇、土壤、植物与湿地生态环境为基础的芦苇科学研究所。2004年盘锦市人民政府批准组建盘锦市湿地科学研究所。
半个多世纪以来，盘锦市湿地科学研究所积极投身于国民经济建设主战场，为国家芦苇产业的发展、湿地生态环境的保护和经济建设做出了重大贡献，共获得科技进步奖36项，出版专著6部，发表论文600多篇，授权专利2项。
盘锦市湿地科学研究所设有科技管理办公室、芦苇湿地研究室、湿地盐生植物研究室、湿地生态研究室、湿地生物保护研究室、芦苇收割机械化研究室、湿地经济研究室、实验室、实验基地、综合办公室。现有职工62人，其中研究员、副研究员18人、中初级专业技术人员27人，获国务院政府津贴的5人。先后被评为国家轻工业部先进单位，辽宁省十佳科研单位。
多年来，盘锦市湿地科学研究所与朝鲜、德国、罗马尼亚、荷兰、芬兰、加拿大等国家的专家，以及江苏、湖南、湖北、山东、河南、吉林、内蒙古、黑龙江、宁夏、新疆等地区的湿地管理部门与芦苇生产企业，开展了卓有成效的技术服务与学术交流活动，并与中国农业科学院、中科院植物研究所、中科院沈阳应用生态研究所、中国气象局沈阳大气环境研究所、中国中医研究院中药研究所、辽宁省环境科学研究院、南京农业大学、沈阳农业大学、盐城工学院、盘锦职业技术学院等高校与科研院所开展了广泛的技术合作。
盘锦市湿地科学研究所的组建，进一步凝炼了学科发展内容。开展对湿地“生命、生存、生态、生机”的科学研究，为“积极保护、科学恢复、合理利用、持续发展”湿地资源提供科学依据和实用技术。紧紧围绕湿地保护和可持续发展中急需解决的重大问题和湿地生态环境的发展需要，通过基础研究，对湿地类型、功能、特征、价值、动态变化进行全面深入、系统的研究，为湿地的保护和合理利用奠定科学基础。加强应用技术研究，包括湿地的保护技术研究，湿地恢复与重建模型，湿地持续利用技术及管理技术研究，湿地效益评价指标体系和湿地与水旱灾害关系等的研究。加强人为管理和开发对湿地生物多样性影响的研究；湿地环境调节功能与生物多样性价值和湿地对全球变化的影响研究等。在基础研究和应用研究的基础上，为我国湿地生态系统保护、退化湿地生态系统的恢复与重建，改善生态环境，制定区域保护计划，有步骤，有目标的开展湿地研究和保护提供理论依据与技术措施。
盘锦市湿地科学研究所二十一世纪的发展目标是：建设成为我国北方湿地研究中心和湿地保护利用科技示范基地。
