南京大学物理学系成立于一九二○年，经历八十多个春秋，现已发展成为国内著名、国际有一定影响的物理系之一。1984年，声学和无线电专业从物理系中调整出来，组建了信息物理系（现改名为电子科学与工程系）；1994年，以物理系中一些研究组为基础，发展成立了材料科学与工程系。
八十多年奋斗，几代人的不懈努力，尤其是借助于国家“211工程”和“985”的东风，物理系在学科建设、科学研究、人才培养等诸方面都取得长足的进展。现有凝聚态物理、理论物理、微电子学与固体电子学三个国家重点学科，设有物理学博士后流动站，理论物理、凝聚态物理、粒子物理与原子核物理、微电子学与固体电子学、光学等五个博士生专业，理论物理、凝聚态物理、粒子物理与原子核物理、微电子学与固体电子学、光学、生物物理学等六个硕士生专业，物理学、应用物理学二个本科生专业和计算机科学与技术、计算机应用与自动化管理、电子商务等三个继续教育本专科专业。建有具有国际先进水平的固体微结构物理国家重点实验室、江苏省两个重点实验室、固体物理研究所、加速器研究所、应用物理研究所、生物医学物理研究所和理论物理研究中心，其中固体微结构物理国家重点实验室于1984年由国家投建，在历次的国家级评估中均获优秀。在科学研究上，目前主持和主要承担着8项国家重大基础研究发展规划（“973”）项目，多项“863”高科技项目、攻关项目以及大量各类基金项目，取得多项标志性成果，一些高科技项目正在实施产业化。SCI论文总数和高水平论文数量一直位居国内高校物理学科前茅。物理学系是国家物理学基础学科人才培养基地，基础教学示范中心。在人才培养上，已形成了从博士后到继续教育完整的人才培养体系。目前，物理系在职教职工200余人（其中有：第三世界科学院院士2名，中国科学院院士9名，俄罗斯科学院外籍院士1名，博士导师46名，教授、副教授112名，长江学者计划特聘教授13名，国家杰出青年基金获得者15名，教育部跨世纪人才4名），在站博士后45人，博士研究生89人，硕士研究生320人，本科生762人及继续教育学生1100人。
物理系具有一流基础研究水平，其国际竞争力不断增强，在国际上有较大影响的基础研究成果逐年增加，与国际上二十多个国家和地区保持着较为密切的科研合作、学术交流和联系。主要研究方向和领域有：“多层膜、超晶格材料与物理”、“纳米材料与团簇物理”、“晶体物理学”、“超导物理学和超导电子学”、“原子核物理和核固体物理学”、“凝聚态物理和统计物理”、“微电子学与固体电子学”、“原子核理论和基本粒子理论”、“生物医学物理”以及“量子光学”等。物理系科研成果丰硕，１９９２以来在国内外核心学术期刊上发表论文数千篇，其中被ＳＣＩ收录的高质量论文二千余篇。近年来获国家自然科学奖７项，国家科技进步奖和国家发明奖各１项，省部级科技进步奖５０多项。
在保持基础研究优势的前提下，物理系大力开拓和扩展应用研究，逐步形成新材料和物理应用的开发能力，包括多种金属材料、金属和半导体的薄膜和超晶格、微波吸收材料、医用和工业用加速器、以及多种电子仪器和设备的研究开发等。
