见址在今吉多乡西南40公里处，最初寺址在囊谦根蚌寺附近的达合山上，山势状若黄羊崽耳朵，故名“更那寺”。由巴绒噶创始人达玛旺秋的再传弟子多丁伊西迥尼（鲁梅多杰的大高徒之一，今四川道罕县贡康人）始建于十三世纪，属巴绒举派。后数迁寺址，曾迁至昌都地区靠近今云南迪庆州的察哇贡和吉多县部乡境内的求松日喔切（原吉曲河桥边）、德孜群郭、帐卜玛等地。公元1673年改宗噶玛噶举派，于现址重建。1958年前，该寺有估主殿3座，禅院1座，活佛拉让3处，寺房30多间，牛200余头，羊约100只，马6匹，寺僧250人（内扎哇20余人，余皆为囊巴）。“囊巴”，意为“咒师”，侓戒要求较宽，以念诵咒语禳灾祈福和为亡人送葬为其主要职业。
更那寺原有活佛3名。其中，寺院创建者多丁伊乃迥尼的转世系统为寺主活佛，共传十三世；二世次成嘉措，亦名噶玛热宗若贝多杰，曾求经于噶玛噶举派黑帽系第三世活佛禳迥多吉（1284—1339）。将本寺从察哇贡迁到求松日喔切；三世丹增却吉坚赞，西藏人，享年49岁；四世文措仲巴，今杂多县中坝巴麻族人，曾求学于噶玛噶举黑帽系第五世活佛得银协巴（1384—1415）；五世文索求吉坚赞，由黑帽系第六世活佛通哇敦丹（1416—1453）授给法名：迁寺于德孜群郭；六世噶玛周扎，玉树结古人；七世索南文措求吉坚赞，西藏羌塘格吉人，从他起正式改宗噶玛噶举派，迁寺于帐卜玛；八世求吉索囊文错；九世乃东求江，亦名朱杰丹增宁保；十世更都求吉坚赞，囊谦尕涌人，终年83岁，颇有影响；十一世更却陈列丹增，西藏桑耶那人，学经于粗朴寺，著有医学书籍《穗孜宁保》；十二世噶玛丹增囊江；出身寒苦，曾遭该寺管家尼哇拉更的诬陷，被中坝麦麻百户赤江挖去双眼；十兰世丹增嘉措；中坝麦麻百户赤江之孙，现主持更那寺寺务。该寺第二个活佛卡杰多吉，是一位掘伏藏者，传有八世，未世叫贤林朱古，卒于1958年。第三个活佛通称久喇嘛，传有三世，其中第一世阿日多顶为禅院的高僧。
更那寺于1988年3月8日批准开放，现有4柱经堂1座僧舍15间，定员僧人20人，实有30人。
