中国烟叶公司设8个内设机构1.办公室:承担公文运转、综合行政事务、印章管理工作；承担公司固定资产、办公用品的购置及日常管理工作；按照规定的权限，管理有关人事工作；承办领导交办的其他事项。
2.综合计划部:
参与拟订烟叶种植、收购、储备和调拨计划；参与拟订烟叶调拨价格；负责组织全国烟叶购销交易；承担购销合同、委托加工合同的管理工作；参与烟叶信息化工作；承担烟叶收购、调拨和工商库存信息统计分析工作；承办领导交办的其他事项。
3.生产管理部（技术推广部）:
承担烟叶生产的组织、指导和协调工作；负责烟叶生产基地建设的指导工作；承担烟叶中外技术合作与交流工作；参与拟订烟叶生产技术标准，参与审定烟草新品种；负责全国烟草种子、肥料、农药、烤房等相关物资、设施、技术的试验示范、质量监测和认证推广工作；承办领导交办的其他事项。
4.收购管理部:
承担烟叶收购的指导、协调、监督工作；参与拟订烟叶收购价格和补贴政策；参与拟订烟叶国家标准，负责对烟叶国家标准的实施工作进行指导、监督；参与组织烟叶国家标准技术培训；核准全国烟叶收购基准样品；承办领导交办的其他事项。
5.基层建设管理部:
研究提出烟叶生产基础设施建设总体规划、实施计划和实施方案，负责基础设施建设的指导工作，组织建设项目验收评价；承担全国烟叶基层站建设和烟叶基层队伍建设的指导、协调工作；承办领导交办的其他事项。
6.复烤企业管理部:
承担打叶复烤企业管理和制度建设的指导工作，参与拟订技术改造规划、技术标准；负责打叶复烤工艺技术交流与推广工作；参与拟订打叶复烤加工费用标准；承办领导交办的其他事项。
7.财务部:
拟订公司财务管理、会计核算办法；承担公司财务管理、会计核算工作；编制并组织实施公司财务预算，负责公司会计决算工作；承担公司国有资产管理工作；承办领导交办的其他事项。
8.经营部:
承担进口烟草专用肥料的经营管理业务；承担进口烟叶国内流通管理工作，参与拟订烟叶进口计划和分配计划，参与进口烟叶的制样、看样验货和监督加工等工作；承办领导交办的其他事项。
