飞航工程师（Flight Engineer，F/E），在旧一代的大型飞机，主要在起飞前与降落后检查飞机，并在飞行期间检查飞机的系统，包括液压操控、燃油消耗、机舱增压、电力等系统。在部分军用飞机，飞航工程师更会进行飞行前的完全检查。基本上，飞航工程师是飞机系统专家，专责解决飞机系统的问题、提供飞行紧急情况的处理方案，并计算起飞与降落的数据。
在旧式民航机与及部分军机上，飞航工程师坐在正副飞行员的后面，并面向侧面的一排仪表。有些军机，例如P-3猎户式飞机与C-130H飞机，飞航工程师则坐在正副飞行员的中间。图波列夫Tu-134更特别，飞航工程师是坐在机头尖端。
由于飞机系统操控的电脑化与自动化，飞机上的电脑系统能自动监察飞机系统，并将故障直接向飞行员报告，目前新型的飞机已经不需要有飞航工程师，大幅节省了航空公司的人力成本。不过，一些现在还在服务中的旧型飞机，例如波音747的-100、-200、-300与-SP，还有洛克希德的L-1011三星飞机与麦道DC-10飞机，仍然需要飞航工程师随航。
部分的航空交通机构，会对于一些同时持有飞行员执照的飞航工程师，称呼为“第二副驾驶”（Second Officer）。
