尽管英国军队已经习惯了使用SA80枪族，但存在的问题却不能无视。最初解决这些问题的方法是由军队的技术人员轮流到各个作战单位对枪支进行改装，
不幸的是改进必须的零部件经常供应不足，而且到了1994年，由于武器停产，连备件都无法供应了。在1996年9月，北约把L85A1从指定的轻武器列表中除名，这事件最终刺激了英国军方高层，决定对SA80进行重大改进，于是H&K公司获得了一份价值1.2亿美元的改进2万支SA80合约，由H&K公司在奥本多夫的分公司实施改进，第一批样枪的改进工作在2001年初完成。专家估计，一旦改进项目完成，SA80枪族的可靠性和效率将不低于现有的任何突击步枪。该项目希望能使SA80的服役期延长至2015年或2020年，同时希望能重返北约武器列表。
改进后的SA80枪族改进型（MoD）也是有步兵武器（IW）和轻型支援武器（LSW）两种型号，IW称为L85A2，LSW称为L86A2。H&K公司的设计小组（主设计师是G36的主设计师）对武器的内部作了很多修改，主要的修改项目包括：
原来的导气杆在极端的温度条件下持续射击时会出现断裂现象。新的导气杆外形和原来的几乎一样，但采用了新材料，并严格控制制造公差，使之不易断裂。
针对原来经常出来抛壳不成功的现象，重新设计了枪机，并换了一个新的抛壳簧，又扩大了机匣上的抛壳口。而枪管节套和枪机的闭锁突笋也都重新设计过。
高速录像显示原来的击锤经常在枪机未完全闭锁时就撞击击针。新设计的击锤改变了重心位置，并使撞击击针的时间比原设计延迟了4毫秒。另外又更换了一个更结实的阻铁。
原来的击针在接近顶端部分容易在持续射击过程中断裂，因此重新设计过击针的形状。
原来设计单薄的拉机柄容易断裂，因此重新设计了拉机柄的外形。
原来的弹匣很容易从枪上自行跌落，而且经过撞击后弹簧和托弹板很容易脱离，至使枪弹不能顺利进入弹膛。因此包括钢制的弹匣体、弹簧和托弹板都全部重新设计过。
换了一个新设计的耐高温型下护木。
另外，还为LSW设计了一种新枪管，希望能解决容易过热的问题。
在2000年至2002年期间约有200,000件SA80武器改装成SA80A2，在多种环境下进行的MRBF（射击中断故障时的平均弹数）试验中，L85A2的平均值达到25,000发，不过在科威特的干热条件下低于8,000发；L86A2由于试验条件更苛刻，因此MRBF平均值较低，稍低于13,000发，但在科威特的试验情况却比L85A2稍微好一点。由于这样的试验结果，公众舆论重新表示了对SA80的信心，而英国军队也为这支步枪而骄傲了。
SA80改进型在2002年2月开始发往部队，匆匆忙忙地用在阿富汗战场上，然而从阿富汗战场上却频频传出SA80A2在使用中出现故障的消息，来自参战部队的报告指这些改进在战斗中根本没有实效。英国的公众传媒又开始重视这些故事，而且有许多声音叫嚷着要扔掉这件有缺陷的武器，英国军队的步枪再次变成全球笑柄。迫于压力，英国国防部长决定向阿富汗派出一个MoD调查小组，趁着皇家海军陆战队突击队暂时停止搜捕“塔利班”和“基地”组织的行动。包括有两名H&K公司专家的MoD调查小组于2002年7月初飞抵阿富汗，在那里，调查小组对所发现的问题感到震惊，因为SA80改进型存在的问题比他们想像的还要严重。
皇家海军陆战队在阿富汗首都喀布尔外的巴格拉姆（Bagram）空军基地为MoD调查小组示范了一次实战演习，演习模拟他们乘坐CH-47“支奴干”直升机着陆后与敌人交火，整个演习过程被拍摄下来作为参考。
当“支奴干”直升机在巴格拉姆着陆时，卷起大量的尘土，海军陆战队员就在尘土飞扬的环境中跳下直升机，跑向靶场，然后向开枪射击，问题就展现出来了。由于有灰尘进入步枪内，导致有部分武器出现射击中断的现象，另外有部分步枪的弹匣在射击过程中自动跌落，更有一些步枪的保险装置不能正常操作。演习中约有30至40把步枪都不能正常使用，占了参加演习总数的1/3。
在调查组的一次会议上，一名资深的海军陆战队军官说如果不经常维护武器就会经常出故障。士兵们说，他们被迫每天清理步枪5次。其中一名士兵说：“如果你在炎热的气温和漫天尘土中跳下支奴干直升机，即使是事先已经清理过步枪也没用。”
H&K的专家鉴定了5个严重的急需改进的问题：
在高温中润滑油会失效；
在射击过程中保险装置不可靠；
太多尘土侵入弹匣时会影响枪弹进入弹膛；
太多尘土侵入步枪内影响运作，专家提议在工作部件上加上一个盖子；
弹匣在步枪上时如果受到碰撞可能导致不能正常供弹。
MoD调查小组把调查结果发给英国国防部长，在国防部公开调查内容之前，许多公众传媒都认为SA80剩下的寿命很短了，因此报导内容集中讨论哪一种新枪可以取代SA80，例如G36。
调查小组的结果正式公布后指出，发生故障的原因多数是由于直升机降落在干燥地面时产生的灰尘导致的，而且与大多数士兵没有按时进行适当的维护和保养有关，解决方法是正确地教授士兵如何分解、组合武器和维护的程序。不但英国国防部支持这一结论，就连《JANS 2003-2004年鉴》前言也为SA80平反，认为是公众传媒的报道言过其实，导致SA80声誉下降，使大多数士兵对SA80缺乏信心。
在2003年，英国士兵带着L85A2在伊拉克战场上战斗，但没有再传出可靠性差的抱怨，但有一部分L86A2却被FN MINIMI轻机枪代替。英国特种部队其实已经采用FN MINIMI多年，并命名为L110A1。由于SA80 LSW持续火力性能低的固有缺点，英国军队决定采用一种真正的轻机枪来补充步兵单位的火力，以提供300m外的压制火力的。但LSW在600m距离上的射击精度非常高，而且L110A1只是MINIMI的伞兵型，因此在一个步兵班中，是同时装备一挺L110A1和一挺L86A2。
2004年底，英国又为车组、机组成员改进了SA80A2的卡宾型。
