中国数字植物标本馆是由中国科学院生物标本馆,植物研究所,昆明植物所,华南植物园,版纳热带植物园,沈阳应用生态所,武汉植物园,西北高原生物所,成都生物所,新疆生地所,西北农林科技大学,广西植物所,江苏省植物所,庐山植物园,四川大学,中山大学,南京大学,南开大学,武汉大学,内蒙古大学,广西中医药研究所等共同创建。
据中国科学院植物研究所所长马克平介绍，数字植物标本馆分为4部分：数字化标本库、植物数据库、电子植物志、植物图片库。数字化标本库目前收录有200多万号一般标本和3000号模式标本。植物数据库提供中国植物名录、植物文献数据库、中国干燥标本集等多项查询。电子植物志包括中国植物志、西藏植物志、青海植物志、秦岭植物志、四川植物志、海南植物志等。网站还上载了240科、1469属、3784种，共计27300张植物彩色照片。标本馆还设有主要国际干燥标本集以及相关数据的搜索引擎。
中国的生物多样性丰富，据《中国植物志》记载，中国拥有3万多个物种，52%为中国特有。中国科学院联合国内其他研究机构建立了中国数字植物标本馆。数字植物标本馆自2004年开始建设，以20世纪的主要标本数据为基础，2006年9月在网络上推出第二版，第三版正在进一步开发中。
中国数字植物标本馆还通过和英、美等国家相关机构的合作，完善标本馆的数据建设和更新。马克平说，中国数字植物标本馆是国内自主开发、建设起来的，但在模式标本、植物学文献库以及世界植物志方面需要和国外进行合作。这些合作一方面实现世界植物研究方面的资源共享，另一方面使中国数字植物标本馆一开始就能够和国际研究接轨。
今年，中国数字植物标本馆计划收集100多万号一般标本和8000多号模式标本。标本馆的最终目标是将中国已有的1600多万号标本全部数字化。
