完全不同的两种系统。
1、windows是商业性质的，Linux基本都是免费（也有几个是要收费的），可以任意下载安装。
2、windows闭源，普通人是不能进行改造的（高手和利用专业软件那些不算）。Linux开源，任何人有兴趣都可以拿到源代码进行改写，作出自己的系统。
3、Windows稳定性差，经常会有死机啊什么的，Linux相对稳定，所以服务器很多用Linux。
4、Windows市场占用率超高，所以针对它的攻击多，安全性差，Linux相对安全。
5、Windows的对应软件多，Linux相对少。
6、最后也是最重要的，windows简单易用，很容易上手。Linux操作要难一些，很多都是命令式的，命令比较难记，这就是为什么在市场占有率上远低于Windows的原因。
补 充一点，linux和windows对普通用户体现出最明显的差别在于使用习惯的不同，包括配置，安装和使用等等等等，linux的用户常常能获得一种什 么都免费，什么都能改，什么都唾手可得的快感，但是使用windows就麻烦一些。同时，初学linux，可能必须做好面对无数稀奇古怪的问题的准备，不 过在这个过程中能学会很多东西。