由军舰护卫，国民党副主席王金平来到钓鱼岛附近海域，高呼“钓鱼岛是我们的领土”。另一名国民党副主席马英九也声称“不惜与日本一战”。
大陆方面，中国外交部于6月上旬和下旬两次警告日本：中国对钓鱼岛及其附属海域拥有无可争辩的主权，日本不得侵害包括台湾地区渔民在内的中国渔民的合法权益。
历史上，即便在严重对峙时期，台海两岸也曾为维护南海国土而“默契地合作”过。这一次，呼声又起——两岸能否携手，共同维护钓鱼岛及其附属海域中国领海领土的安全
马英九：不惜与日本一战
6月21日，台“立法院长”王金平带领10余名“立委”，在“国防部长”李杰的陪同下，乘“凤阳”号军舰巡弋钓鱼岛附近海域。
王金平在舰上表示，台湾渔民经常被日方无理扣留，他这次是要给渔民安心，让渔民有安全感。他与同行“立委”站在甲板上高呼：“钓鱼岛是我们的领土。”王金平还说，在捍卫主权问题上他绝不妥协，“日后也不排除登上钓鱼岛宣示主权”。
由于“立法院”掌握“国防预算”大权，台军方不敢怠慢，派遣其他军舰护卫，并通过雷达与情报系统监控邻近海域。台军F—16战斗机也一直在空中巡逻。据岛内媒体报道，台军还制定了从“日方毫无动静”到“日方有所行动”等6种状况的应对方案。
岛内媒体认为，这次“护渔”行动虽有“做秀”之嫌，但实属来之不易。近年来，台湾渔船在钓鱼岛附近传统渔场捕鱼时，时常受到日本巡防艇的无理警告、驱赶甚至扣押、罚款。渔民代表林棋山警告称，如果问题得不到解决，未来不排除悬挂大陆五星红旗以自救的可能。岛内各界也纷纷要求民进党当局采取措施“护渔”，不要在日本人面前做“软脚虾”。台北市长马英九更是发出“不惜与日本一战”的强硬声音。在巨大的压力面前，民进党当局被迫派军舰“护渔”。
大陆为台湾渔民撑腰
岛内学者研究指出，台湾与日本西南列岛的一些小岛礁距离不远。日本靠着这些小岛礁，竟然划出了将台湾岛及其附近海域全部囊括在内的专属经济区。台湾的200海里专属经济区也将琉球群岛的部分海域划了进来。台湾“农委会渔业署”提供给渔民的“台日周边水域图”显示，台日重迭的经济海域中有一条日本主张的“中间线”。
宜兰县苏澳区渔会总干事林月英指出，这条所谓的“中间线”划到宜兰外海，距离苏澳或花莲只有20余海里，非常不公平。台湾渔船一出海就会跨过“中间线”；受洋流影响，渔民的网具稍有不慎就会进入所谓的日本“专属经济区”，并多次因此被扣押甚至罚款。
对于台湾渔民的遭遇，大陆十分关切。6月9日，外交部发言人刘建超指出，钓鱼岛及其附属岛屿自古就是中国领土，中方对此拥有无可争辩的历史和法律依据。日方强行驱赶在该海域正常作业的台湾渔民，是对中国主权权益的侵害。他还表示，中方对此表示强烈不满，并已向日方提出交涉，要求日方高度重视中方关切，切实慎重妥善处理有关问题。
6月21日，刘建超再次重申了中国对钓鱼岛及其附属海域拥有无可争辩的主权的立场，并强调中国政府高度重视、维护包括台湾地区渔民在内的中国渔民的合法权益。
台军曾计划攻取钓鱼岛
事实上，在维护领海主权问题上，大陆与台湾虽绝少直接合作，却一直在有效地“呼应”。
蒋介石当政时，台湾主要驱逐舰都曾到钓鱼岛附近海域巡逻。美国托管钓鱼岛期间，蒋介石也一再表示该岛属于中国。当时，美军演习须以钓鱼岛为目标时，都要事先向台当局申请许可。
台海军退役中将兰宁利最近证实，为反制日本对钓鱼岛的侵占企图，1990年，台“国防部”秘密拟定“汉疆演习”作战计划——45名伞兵突击队员搭乘8架直升机强登钓鱼岛，炸毁日本灯塔设施、插上“中华民国国旗”后，由军机和战舰掩护撤离。兰宁利还透露，当时的作战构想十分细致，甚至包括“若直升机还未飞到钓鱼岛就被日舰或日机击落，那么海军陆战队就要增援上岛，台海军和空军都要实施火力压制”等内容。据曾经参与该计划的突击队员透露，他们个个热血沸腾，准备慷慨赴死。队员们都在衣物上写下自己的姓名、兵籍号码，以便身体被炮火击碎后仍可辨认。但就在他们要出发的时候，行动计划被李登辉取消
在南海诸岛问题上，上世纪50年代中，菲律宾对南沙群岛提出主权要求，台当局立即作出强烈反应。1956年5月下旬，台“外交部”数次以声明、照会和约见菲官员的方式，声明南沙群岛是中国领土，中国主权不容侵犯；6月上旬，台“国防部”宣布，台湾海军有巡弋所有领海及领土海面之责任。台军先后组织“立威”舰队和“威远”特遣支队奔赴南沙太平岛，并最终完成了对太平岛的重驻任务。
为西沙，蒋介石下令放行解放军
两蒋主政台湾时期，两岸甚至有过“默契的合作”
1974年，大陆为反击南越武装侵占西沙群岛，决定展开自卫反击战。1月19日，西沙反击战打响，中央军委急调东海舰队4艘军舰赴西沙驰援。由于台湾海峡长期被台军和美国第七舰队控制，以往解放军舰艇来往于东海与南海之间，都要绕道台湾东南的公海，以避免引发摩擦和冲突。此次因军情紧迫，大陆军舰奉令直接从台湾海峡通过。
台军在蒋介石“西沙战事紧”的指示下，不仅没有开炮，还打开探照灯方便解放军舰队顺利通过。洛杉矶著名政论家于摩西称，他在蒋介石的大溪官邸发现了蒋当时的手令，其中写道：“查我东海舰队，赴西沙作战，沿线我国军，开放航道，太平岛军医院随时待命，救治西沙之战伤员……”台海军还为解放军舰队一路护航，几十艘台湾补给船也开赴西沙，为前线的解放军战士运送食物和淡水……在今天看来，此细节真实与否已显得不那么重要，大陆军舰“破例”从台湾海峡顺利穿过的事实证明，那个时候，两岸在维护国家领土安全上，站在了一起
另据报道，1988年，在同越南海军发生冲突以前，大陆舰艇编队曾在南沙太平岛停靠一周，补充了大量的淡水和主副食品。海峡两岸在关乎国家主权时血浓于水的亲情，再一次得到了充分体现。
民进党要大陆“别插手”
两岸携手维护国土安全有没有可能？谜底须由台当局来揭开
在维护国家领海主权方面，正像中国外交部一位官员所说：台湾宣称“拥有南海岛礁主权”，立场与大陆完全相同。但分析人士认为，在两岸合作方面，台当局却在步步倒退
2003年年初，日本制造“从国民手中租借钓鱼岛”的事端后，国民党籍“立委”关沃暖建议海峡两岸应该合作，共同抗击日本的侵略行径。但是，台当局“外交部长”简又新却说，台湾不会考虑在这个议题上与大陆合作。
在此次在野党发起的“护渔”行动中，陈水扁要求随舰出海的“总政战局局长”胡镇埔“随机应变”，不与日本发生“不必要的误会”。台当局还为7月29日举行的第15轮台日渔业谈判定下基调，其中包括不谈钓鱼岛主权问题、不与大陆合作等原则。6月22日，台“外交部”甚至呼吁大陆不要插手台日渔业纠纷。
对此，《中时电子报》质疑说，日本其实很担心两岸携手对抗日本，在海上围堵日本船舰。在此情况下，台湾即使不表明要跟大陆合作，也会迫使日本拿出诚意。
此外，在南沙主权问题上，民进党当局在宣称拥有南沙主权的同时，却取消了军舰巡逻的计划。有分析指出，陈水扁是希望在钓鱼岛和南海问题上保持低调，以换取日本和东南亚国家的支持，保证台日军事合作和其“南向”政策得以顺利实施。
新闻链接
英国广播公司6月27日
台湾渔船又被日巡逻艇驱逐
台湾一艘渔船在台日“主权重叠”的海域边缘被日本巡逻艇驱逐。日本巡逻艇还散发传单，呼吁台湾渔船不要“超过界线”。
这艘台湾宜兰县苏澳籍“金瑞丰168号”渔船，在所谓的“暂定执法线”边缘附近收到日本巡逻艇散发的传单，被要求立即离开日本的“经济海域”。
台湾海巡署得知消息后，即刻派遣正在附近的几艘巡逻舰艇前往支援。台湾海巡署说，会尽力在执法线保护渔民的安全与权利
在两年前，日本单方面宣布划定两百海里经济海域之后，照日本的基点划分方式，日本的经济海域立即扩大到台湾北部外海，造成日台之间所属海域大区域的重叠，从而也引发了多次纠纷。
台湾《中国时报》6月27日
台湾知识界展开保钓护渔行动
台湾中央研究院副院长曾志朗、前暨南大学校长李家同、文化评论者南方朔等在全球各地从事学术、文化、艺术等工作的知识界人士，已共同联署一份《全球华人知识界保钓护渔行动声明》，并将在今日召开记者会，要求台湾政府严正对外宣示钓鱼岛的主权归属台湾。
发起这项联署行动的“民主行动联盟”表示，7月29日台日双方即将在东京展开渔权谈判，台湾在尚未开始谈判前便宣称“搁置主权争议，只处理渔权问题”，这对向来主张台湾是一个“主权独立国家”的执政当局而言，是多么的不可思议。民主行动联盟表示，没有主权的渔权，是假渔权，是仰人鼻息的渔权，这样的渔权是绝对得不到保证的。双方谈判须从主权谈起，主权有了结果，渔权方能保障
该联盟要求执政当局秉持为中国争主权的精神来面对日本。
