《水世界》中的副本面向30级以上的玩家开放，玩家前往对应地图，与相关NPC对话，接受任务后即可进入副本挑战。副本内不能查看小地图，避雷药剂在此也无效。玩家需要挑战完副本的所有BOSS才能完成任务。副本中，玩家可以找到相关NPC来随时传送回副本外。副本一般拥有两种难度，分别对应不同等级的玩家。通过击杀BOSS，玩家可以获得高品质的装备奖励，以及一些重要的消耗品道具。
1．死亡沉船：一条在远古时期沉没的商船，现在那里已经充满了亡灵。
所在地图：死亡深渊
建议等级：30-35
建议人数：5人
2．奇迹之泉：蕴含奇特物质、能够奇迹般改变生物进化的温泉，被许多凶恶的怪物看守着。
所在地图：白沙温泉
建议等级：40-45
建议人数：5人
3．罗兰城堡：由一名神秘的大法师用咒语创建，里面充满了他创造和召唤的各类魔法生物。
所在地图：琉璃谷
建议等级：50-55
建议人数：5人
4．勇士墓穴：原本是勇士们安眠之所，不知为何他们重新醒来，成为了邪恶势力的帮凶。
所在地图：神罚之地
建议等级：60-65
建议人数：5人
5．黑暗修道院：黑暗天使族在水世界里的据点之一，是一个被神诅咒的地方。
所在地图：黑暗高原
建议等级：70-75
建议人数：5人
6．灰烬熔炉：末日军团在此利用火山口的高温，冶炼强大的武器。
所在地图：火山口
建议等级：80-85
建议人数：5人
7．远古之树：上古时期一颗巨大的神树，大沉没中随着大陆一起到了海底。
所在地图：铁石密林
建议等级：90-95
建议人数：5人
8．众神战场：列神在大战役中战斗的地方，那里留下了他们的诸多痕迹。
所在地图：遗忘之川
建议等级：100
建议人数：5人
