年的大部份被用于训练机组人员，只进行了少许轰炸任务。最值得注意的是 1943 年 8 月 20
日对勒托游击队村落的袭击（全中队都参与），及对拉凡沙里（Lavansaari）机场的袭击（导致七架 Ju 88
因在严苛天候中迫降而受损）。在 1943
年夏季里，芬兰人注意到机翼上的应力损伤。这是在飞机用于俯冲轰炸中而发生的。限制紧接而来：俯冲减速板被拆除，而飞机只能以 45
度角度俯冲（相较于先前之以 60-80 度角）。他们试图藉此方式，让飞机免受不必要的磨耗。
比较值得注意的任务之一是于 1944 年 3 月 9
日对圣彼得堡附近卡西莫夫机场的袭击，及于 1944 年 3 月 22 日对位于 Petsnajoki 之 Aerosan
基地的袭击。在苏联的第四次战略攻势作战期间，整个轰炸机团都参与了防卫作战。在天候许可下，所有的飞机每天不分昼夜的飞行好几次的任务。在拉普兰战争期间，第
44 中队隶属于 Lentoryhmä Sarko（当时为对抗德军），而 Ju 88
被用于侦察和轰炸双方面。目标大多为车辆纵队。同时也对挪威北部进行了侦察飞行。最后一次战争任务是在 1945 年 4 月 4 日飞行的。
在战后，芬兰被禁用有机内弹舱之轰炸机。因此，芬兰的 Ju 88
飞机被用于训练直到 1948 年。在后续年间飞机陆续被报废。没有一架芬兰 Ju 88
被留存下来，但在中部芬兰航空博物馆有一具引擎供展示，及在凡塔（Vantaa）的芬兰航空博物馆有保存一具德制 Ju 88 座舱盖的框架。
