庙岛显应宫位于庙岛东北部，始建于宋徽宗宣和四年，长岛渔民祖祖辈辈敬称“海神娘娘”庙。明宗祯元年，崇祯皇帝御赐庙额“显应宫”。
显应宫大殿是全庙最大的建筑，为硬山式结构，殿内妈祖坐像居正中神龛龙墩上，殿两侧有14尊站班，殿外两侧房内存有碑、碣、匾200余块和历史船模300余艘。后宫建筑风格为歇山式，保留了明代的特点。宫内殿正位神台有铜铸镀金天后圣母像及2米高的九华青铜穿衣镜一面，各种服饰用品及床帐、摆设应有尽有，黑脸妈祖也在显应宫落户，这里常年香火不断，每年的元宵节和娘娘生日，显应宫便有万余人朝拜。
妈祖庙之所以建于庙岛，是因为庙岛形若凤凰，其身倍的烧饼岛形如太阳，两岛相映，状若“丹凤朝阳”，属上上风水宝地。在那里还可以观赏关帝庙、三元宫及我国第一座综合性航海博物馆等景点。
