生物大分子的X射线晶体学
分類: 图书,自然科学,化学,晶体学 ,
作者: 柯衡明,陈玉祥,蔡继文编著
出 版 社: 化学工业出版社
出版时间: 2010-1-1字数: 200000版次: 1页数: 179印刷时间: 2010-1-1开本: 16开印次: 1纸张: 胶版纸I S B N : 9787122069535包装: 平装内容简介
本书主要介绍了生物大分子X射线衍射晶体学的基本原理,包括蛋白质的纯化和晶体的培养、晶体的表征、X射线衍射原理、蛋白质晶体结构分析的主要方法和手段、重原子衍生物的制备、分子置换法解析晶体结构、蛋白质模型的构建、电子密度图的解析以及结构精修等。本书结合第一作者柯衡明教授多年从事蛋白质晶体结构分析所积累的经验,总结了在蛋白质纯化、蛋白质及其重原子衍生物晶体的培养、数据处理和结构分析过程中常见的问题和解决方法。
本书可作为从事结构生物学研究的科研工作者的参考书和研究生的教材。
目录
1大分子结构测定概述
参考文献
2生物大分子的结晶
2.1结晶的理论基础
2.2影响结晶的因素
2.3结晶方法
2.4结晶的实用心得
2.5结晶过程的自动化
参考文献
3晶体的表征
3.1晶系
3.2对称性与空间群
3.3对称性的矩阵表示
3.4晶胞的不对称单位
3.5倒易晶胞
参考文献
4X射线衍射原理
4.1X射线的产生
4.2一个电子的散射
4.3一个原子对X射线的散射
4.4一个分子对X射线的散射
4.5衍射的中心对称性
4.6布拉格衍射定律
4.7爱瓦尔德衍射球
4.8衍射空间的对称性
5帕特森函数
5.1相角问题简介
5.2帕特森函数
5.2.1帕特森函数的理论基础
5.2.2帕特森图的解析
参考文献
6同晶置换
6.1同晶置换理论
6.2相角计算
6.3重原子的最小二乘法精修
6.4重原子最大概率精修
参考文献
7多波长反常衍射
7.1多波长反常衍射的原理
7.2反常散射的差异
7.3吸收限
7.4MAD的实验设计
7.5MAD中相位的计算
参考文献
8相位优化
8.1溶剂平滑法
8.2直方图匹配
8.3局部或非晶体学对称性平均
8.4相位组合
参考文献
9重原子衍生物的制备
9.1同晶现象
9.2溶液中影响重金属结合的原因
9.2.1pH值的影响
9.2.2缓冲液
9.2.3沉淀剂
9.2.4重金属浓度、浸泡时间和温度
9.3重金属概论
9.3.1汞
9.3.2铂、金、钯
9.3.3铱和锇
9.3.4铀酸盐和阳离子试剂
9.3.5氙
9.4MAD实验用的重原子
9.5硒代甲硫氨酰蛋白质突变体的制备
9.6硒代甲硫氨酸内切酶Nae Ⅰ表达的实验设计(Ke’s Lab,UNC,August 1998)
9.6.1大肠杆菌细胞的增殖
9.6.2改良的M9培养基的制备
参考文献
10分子置换法
11蛋白质的结构
12电子密度图的解析与模型构建
13结构精修