计算机辅助分子生物学实验设计与分析
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作者： 李伍举主编
出 版 社： 军事医学科学出版社
出版时间： 2009-4-1字数：版次： 1页数： 256印刷时间：开本： 16开印次：纸张：I S B N ： 9787802450752包装： 平装内容简介
本书为生物医学实验技术系列丛书分册之一。全书包含5篇共26章和4个附录，内容涉及PCR实验设计、RNA二级结构预测、核酶设计、反义核酸设计、siRNA设计、pBV220载体中外源基因高效表达设计、pPIC9载体中外源基因高效表达设计、B细胞抗原表位预测、T细胞抗原表位预测、蛋白质三级结构预测与显示、蛋白质功能位点分析、寡核苷酸芯片探针设计、基于基因表达谱的差异基因识别、基于基因表达谱的样本分类、基于基因表达谱的样本聚类、利用Perl和Bioperl进行生物信息学分析和利用MatLab进行生物信息学分析等，对加快实验进程和提高实验的成功率具有一定帮助。
可作为分子生物学实验技术人员的参考书，也可作为在校生物医学类本科生与研究生的入门参考书。
目录
第一篇生物信息学基础
第1章生物信息学数据库简介
第2章生物信息学软件简介
第3章序列比较与进化树构建
第二篇核酸序列分析
第4章DNA序列翻译为蛋白质序列
第5章限制性酶切位点分析
第6章转录因子结合位点预测
第7章启动子预测
第8章PCR实验设计
第9章RNA二级结构预测
第10章核酶设计
第11章反义核酸设计
第12章siRNA设计
第13章大肠杆菌系统pBV220载体中外源基因高效表达设计
第14章酵母系统pPIC9载体中外源基因高效表达设计
第三篇蛋白质序列分析
第15章蛋白质基本性质分析
第16章蛋白质跨膜区预测
第17章蛋白质信号肽预测
第18章B细胞抗原表位预测
第19章T细胞抗原表位预测
第20章蛋白质功能位点分析
第21章蛋白质二级结构预测
第22章蛋白质三级结构预测与显示
第四篇基因表达谱分析
第23章寡核苷酸芯片探针设计
第24章基于基因表达谱的差异基因识别．
第25章基于基因表达谱的样本分类
第26章基于基因表达谱的样本聚类
第五篇附录
附录1 利用Perl和Bioperl进行生物信息学分析
附录2 利用MatLab进行生物信息学分析
附录3BioSun软件介绍
附录4相关网址列表
结束语
书摘插图
第2章生物信息学软件简介
1 概论
随着多种类型的海量生物信息数据的产生，从中挖掘生物信息和提取知识，并基于这些知识解决生物学问题的一门新兴学科——生物信息学／计算生物学应运而生，其中，以解决生物学问题（理论与实验两个方面）为生物信息学／计算生物学的灵魂所在。事实上，对生物医学工作者来说，他们主要关心的事是如何利用生物信息学的方法和软件工具来分析他们在研究中产生的实验数据和从中提取有生物学意义的信息，为进一步的研究提供帮助，或对实验进行辅助设计以增加实验的预见性。因此，开展分子生物学实验辅助设计的理论研究和软件设计具有重要意义，可以促进生物医学研究逐渐从定性阶段走向定量阶段，进而加快实验进程和提高分子生物学研究的效率，使生物信息学成为生物医学工作者的得力助手，对生物医学研究具有一定的推动作用。
2生物信息学软件分类
随着生物数据规模的不断增长，对数据进行综合分析的难度不断加大，生物医学研究者越来越依赖于生物信息学软件及相关的服务平台来进行数据分析。目前，主要有下列三种形式的软件工具可供利用。
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