（1）农业部：确认突发特别严重的高致病性禽流感疫情后，由农业部向全国发出红色预警，根据情况及时向国务院提出启动全国应急预案的建议，并建议国务院启动应急反应机制，统一领导和指挥突发高致病性禽流感疫情的扑灭工作。
（2）地方兽医行政管理部门：
①组织动物防疫监督机构开展突发高致病性禽流感疫情的调查与处理；划定疫点、疫区、受威胁区。
②组织突发高致病性禽流感疫情专家委员会对突发高致病性禽流感疫情进行评估， 向同级人民政府建议，启动突发高致病性禽流感疫情应急反应的级别。
③在受威胁区组织开展紧急免疫。
④县级以上人民政府兽医行政管理部门负责对本行政区域内应急处理工作的督导和检查。
⑤开展有关技术标准和规范的培训工作。
⑥有针对性地开展高致病性禽流感防疫知识宣教,提高群众防控意识和自我防护能力。
⑦组织专家对突发高致病性禽流感疫情的处理情况进行综合评估，包括疫情情况、现场调查情况、疫源追踪情况以及对扑杀家禽、无害化处理、消毒、紧急免疫等措施的效果评价。
（3）地方动物防疫监督机构：
①县级以上动物防疫监督机构做好突发高致病性禽流感疫情的信息收集、报告与分析工作。
②组织疫病诊断和流行病学调查，向兽医行政管理部门报告结果，提出并实施有针对性的防控措施。
③按规定采集病料，送国家参考实验室确诊诊断。
④承担突发高致病性禽流感疫情应急处理人员的技术培训。
