造成你电脑有两个系统是你在装新的系统时，C盘没有进行格式化。你只要再次重装一下系统的时候，注意C盘格式化就可以了。
病毒一般在你重装系统时就没了。除非你电脑另外几个盘里有安装程序带有病毒的（如小游戏、电影、某些应用软件等），运行程序才会再次中毒。
参考一：
请点击http://tech.sina.com.cn/s/s/2005-03-31/***********.shtml视频教程
以下为参考图解，希望对你有帮助！
《操作系统》安装过程详细图解（里面有几个常用系统供你参考）
http://www.onlinedown.net/soft/37660.htm
最全的操作系统安装图解，详细到每一步的安装。 Windows 98光盘启动安装过程详细图解 、Windows Me光盘启动安装过程 、Windows 2000 server光盘启动安装过程详细图解、 Windows 2003标准版光盘启动安装过程详细图解 、Windows longhorn长牛角4074英文测试版光盘安装过程详细图解、 Windows xp光盘启动安装过程详细图解 、Turbolinux-7-Server拓林思服务器版光盘安装过程详细图解、 OpenDesktop 1.0开放桌面操作系统光盘启动安装过程详细图解共创桌面、Linux 2005光盘启动安装过程详细图解、红帽子Red Hat Linux 9光盘启动安装过程图解、红旗Linux桌面版 4.0光盘启动安装过程图解(Red Flag Linux 4.0)
参考二：
第一步，设置光盘启动：
所谓光盘启动，意思就是计算机在启动的时候首先读光驱，这样的话如果光驱中有具有光启功能的光盘就可以赶在硬盘启动之前读取出来（比如从光盘安装系统的时候）。
设置方法：
1.启动计算机，并按住DEL键不放，直到出现BIOS设置窗口（通常为蓝色背景，黄色英文字）。
2.选择并进入第二项，“BIOSSETUP”（BIOS设置）。在里面找到包含BOOT文字的项或组，并找到依次排列的“FIRST”“SECEND”“THIRD”三项，分别代表“第一项启动”“第二项启动”和“第三项启动”。这里我们按顺序依次设置为“光驱”“软驱”“硬盘”即可。（如在这一页没有见到这三项E文，通常BOOT右边的选项菜单为“SETUP”，这时按回车进入即可看到了）应该选择“FIRST”敲回车键，在出来的子菜单选择CD-ROM。再按回车键
3.选择好启动方式后，按F10键，出现E文对话框，按“Y”键（可省略），并回车，计算机自动重启，证明更改的设置生效了。
第二步，从光盘安装XP系统
在重启之前放入XP安装光盘，在看到屏幕底部出现CD字样的时候，按回车键。才能实现光启，否则计算机开始读取硬盘，也就是跳过光启从硬盘启动了。
XP系统盘光启之后便是蓝色背景的安装界面，这时系统会自动分析计算机信息，不需要任何操作，直到显示器屏幕变黑一下，随后出现蓝色背景的中文界面。
这时首先出现的是XP系统的协议，按F8键（代表同意此协议），之后可以见到硬盘所有分区的信息列表，并且有中文的操作说明。选择C盘，按D键删除分区（之前记得先将C盘的有用文件做好备份），C盘的位置变成“未分区”，再在原C盘位置（即“未分区”位置）按C键创建分区，分区大小不需要调整。之后原C盘位置变成了“新的未使用”字样，按回车键继续。接下来有可能出现格式化分区选项页面，推荐选择“用FAT32格式化分区（快）”。按回车键继续。
系统开始格式化C盘，速度很快。格式化之后是分析硬盘和以前的WINDOWS操作系统，速度同样很快，随后是复制文件，大约需要8到13分钟不等（根据机器的配置决定）。
复制文件完成（100％）后，系统会自动重新启动，这时当再次见到CD-ROM.....的时候，不需要按任何键，让系统从硬盘启动，因为安装文件的一部分已经复制到硬盘里了（注：此时光盘不可以取出）。
出现蓝色背景的彩色XP安装界面，左侧有安装进度条和剩余时间显示，起始值为39分钟，也是根据机器的配置决定，通常P4，2.4的机器的安装时间大约是15到20分钟。
此时直到安装结束，计算机自动重启之前，除了输入序列号和计算机信息（随意填写），以及敲2到3次回车之外，不需要做任何其它操作。系统会自动完成安装。
第三步，驱动的安装
1.重启之后，将光盘取出，让计算机从硬盘启动，进入XP的设置窗口。
2.依次按“下一步”，“跳过”，选择“不注册”，“完成”。
3.进入XP系统桌面。
4.在桌面上单击鼠标右键，选择“属性”，选择“显示”选项卡，点击“自定义桌面”项，勾选“我的电脑”，选择“确定”退出。
5.返回桌面，右键单击“我的电脑”，选择“属性”，选择“硬件”选项卡，选择“设备管理器”，里面是计算机所有硬件的管理窗口，此中所有前面出现黄色问号＋叹号的选项代表未安装驱动程序的硬件，双击打开其属性，选择“重新安装驱动程序”，放入相应当驱动光盘，选择“自动安装”，系统会自动识别对应当驱动程序并安装完成。（AUDIO为声卡，VGA为显卡，SM为主板，需要首先安装主板驱动，如没有SM项则代表不用安装）。安装好所有驱动之后重新启动计算机。至此驱动程序安装完成。
