天然水晶目前没有严格的国际分级标准，各市场有不同的定义。下面是一个不算严格的业内约定。鉴定的依据是不借助放大镜时肉眼观察的结果，主要针对白水晶，有以下几种级别：
AA级：整个水晶里外通透无瑕疵，表面没有可见的人为瑕疵。
A1级：有极细微的瑕疵，或细小的天然内含物，不超过3毫米的云雾或絮。
A级 ：有轻微瑕疵，肉眼很容易看得见云雾或棉絮。
AB级：有大块的云雾内含物，有小冰裂痕，表面有细小划痕。
B级：整颗水晶中一半以上都是云雾和内含物，大块的冰裂痕，表面有较小裂痕。
C级：最低一级，整体呈云雾状，冰裂痕迹很明显，表面也有明显裂痕，好像随时会碎。
水晶的价值还与晶体大小相关，同样级别晶体越大越难得，有时候级别较低但晶体够大，也可能价格高于高级别小晶体。由于天然水晶的开采和制作原因，不产生瑕疵的水晶很难得到。或者是用一大块水晶磨制出一件小饰品，AA级的产品已不多见，是市场上的极品，具有很高的收藏价值。在目前市场上，能得到A1级和A级的天然水晶已为令人羡慕。另外，由于水晶的特性，在佩戴过程中，也会改变其等级，比如因为各种原因，可能会逐渐产生较大冰裂。
