天珠的起源可追溯到公元前3000年至1500年之间，阿利安人的印度古国。当时的人们为求神佛庇佑，天珠因此被创造出来。当时人们以古老文献中记载的咒术、图腾等符号图案造型(也就是现在天珠上的各种图案)，画于石材上，进于达到提升精神(灵魂)意识的效益。依《吠陀经》记载：远古时因受地理环境及天然灾害的影响，求神助佑之心自然产生，“天珠”因而被创造出来。同时，渗进了各种药物治病，并用巫术咒语的图腾意念，符画于石材上，借以获得诸佛众神 的加持与护佑。
天珠用于敬奉佛菩萨之事迹具代表性的记载为唐太宗贞观十五年（公元六四一年）文成公主下嫁吐蕃赞普弃宗弄赞时，带了一尊从印度请来的佛像作为陪嫁，最后这尊佛像坐落西藏拉萨大昭寺的释迦殿内后，而这尊佛像即被西藏人民镶上了百余颗各式各样的天珠，包括三颗九眼天珠，及三眼天珠、二眼天珠、宝瓶天珠（或称永生瓶天珠）、虎纹天珠和其它带眼天珠。目前这尊佛像安奉于拉萨(Lhasa) 大昭寺的释迦殿内。
据史料记载，于圆和吐蕃之间的草原信道，是西藏与北方草原文化进行交流的重要途径，这条古道至少在公元前5世纪便已开通。悠久的历史，美丽神秘的传说，加之西藏人虔诚地收藏供养，世代相传，天珠便成为人们心中中珍贵的宝物了。
天珠的理论
原始传统佛教创造宇宙的成份，则是由水、火、地三大元素所构成，依次配合圆形、三角、方形之图案。形色一体两面，概略说明：
“○”圆形，宇宙现象界周而复始之理，为宇宙动力的源头。开为白色，象征日、月、星所散发出来的无限光明。
“△”三角，人体本身之血液循环系统，为创造人体能源的基础。人为赤色（陆地上所有的动物的血色系指红血球、白血球、血小板等三角关系），象征精、所、神所显示的微妙生命力。
“□”方形，自然界一切物质所产生出来的力量（磁场），具有凝聚及增强的作用。地为黄色，象征水、火、风所构成的事业契机。
这些古老的图案造形，亦即包含宇宙的运行和人类的思维！也就是这样左右了人类的思想和行动。
今日科学昌明，整个世界的缘起现象，物理现象、化学现象和生物现象等，似乎与佛学思想息息相关。事实上，诸佛菩萨、天地鬼神、赤珠宝石和自然科学！皆是宇宙生命的共同体。佛即众生，众生即佛，不同瑞同。最重要在于自性之心，也蕴含著全宇宙生命的本源。
