材料科学与工程系建于1988年，由原工程物理系材料物理教研组，原机械工程系金属材料教研组和化学工程系无机非金属材料教研组组建而成。 建系十余年来，在国家有关部门，学校的多方面关心支持下，在全系教职工的共同努力下，材料科学与工程系已经成为国内高校同类院系中学科领域齐全，综合实力较强的系人才培养和科学研究基地之一。
清华大学现设有学院12个，共44个系。其中环境科学与工程系、电机工程与应用电子技术系、工程物理系、化学工程系、材料科学与工程系为独立系，其他系归学院管理。材料科学是当今世界重点发展的带头学科之一。根据拓宽基础和专业面的原则，材料系目前只设一个本科专业--材料科学与工程专业，含材料物理、金属物理、无机非金属材料、复合材料、电子材料等5个学科培养方向，在材料物理与化学、材料学、核燃料循环与材料等专业上具有博士和硕士学位授予权。该系教师中有院士4人。系内设有先进陶瓷与精细工艺国家重点实验室。1997年，以材料系为主，并联合化工系、物理系、核研院、机械系和化学系等有关院系的研究力量，成立了材料科学与工程研究院，院长为朱静院士。现任院长为南策文教授。
