伊犁一直是新疆通往中亚的重要通道，历史上曾建有许多城镇在这里发展贸易。
清代乾隆为了加强在伊犁地区的治理，在今新疆霍城县设伊犁将军，建惠远城，并陆续在其周围建起惠宁城、绥定城、广仁城、宁远城、瞻德城、拱宸城、熙城、塔尔奇城八座卫星城，统称为“伊犁九城”。
现保存较好的是被称为“伊犁九城”之首的惠远城，是当时我国西陲军、政治中心的伊犁将军府所在地。
1860年腐败无能的清政府与沙俄签定《中俄北京条约》，使得伊犁西部巴尔喀什湖以东以南的大片领土沦丧。
1871年6月，沙俄武力入侵，吞占了伊犁九城。
1876年民族精英左宗棠收复新疆，伊犁重新回到祖国怀抱。
1884年10月，清朝政府成立新疆省，政治中心移至迪化（即乌鲁木齐），后在伊犁，设伊塔道、伊犁府等。
